RNA–Protein interactions for RNA: YOR248W

YOR248W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YOR248W, Length 303 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR248W	YOR248W	VAC8	P39968	578 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	SIT1	P39980	628 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	STU2	P46675	888 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	SVF1	Q05515	481 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	TOK1	P40310	691 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	IRR1	P40541	1150 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	CEP3	P40969	608 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	TPO2	P53283	614 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	MTH1	P35198	433 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	CTF8	P38877	133 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	GND2	P53319	492 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	HDA1	P53973	706 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	TIM44	Q01852	431 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	IRC10	Q08118	586 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	FRE5	Q08908	694 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	SWM1	Q12379	170 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	CTF13	P35203	478 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	PPS1	P38148	807 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	SPC42	P36094	363 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	YBR184W	P38299	523 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	ELO3	P40319	345 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	ATF1	P40353	525 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	PFD1	P46988	109 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	LCD1	Q04377	747 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	TRM11	Q12463	433 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	MET3	P08536	511 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	REC104	P33323	182 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	YBR284W	P38150	797 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	FKH2	P41813	862 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	MRPS35	P53292	345 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	DLT1	Q04216	342 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	RPP1	P38786	293 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	YHR078W	P38799	552 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	ALR2	P43553	858 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	SDS3	P40505	327 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	MUP1	P50276	574 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	PUS2	P53167	370 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YOR248W	YOR248W	VHR1	P40522	640 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	ADY4	Q05955	493 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	UBX5	Q06682	500 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	FMP25	Q08023	583 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	CDC11	P32458	415 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	YHL017W	P38745	532 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.01	□□□□□ -1.77	not detected
YOR248W	YOR248W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	BDF2	Q07442	638 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	MPH2	P0CD99	609 aa		4	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	PET10	P36139	283 aa		4	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	DAS1	P47005	663 aa		4	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	ASI2	P53895	289 aa		4	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	ENV7	Q12003	364 aa		4	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	HAL9	Q12180	1030 aa		4	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	YBR053C	P38235	358 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	PKH1	Q03407	766 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	CRR1	Q05790	422 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.99	□□□□□ -1.77	not detected
YOR248W	YOR248W	YOR022C	Q12204	715 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	YJL163C	P46996	555 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	EAF1	Q06337	982 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	SUT2	Q12286	268 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	TOP3	P13099	656 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	PEX2	P32800	271 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	PCL5	P38794	229 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	PZF1	P39933	429 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YOR248W	YOR248W	DAL7	P21826	554 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YOR248W	YOR248W	ARE1	P25628	610 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YOR248W	YOR248W	TDP1	P38319	544 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YOR248W	YOR248W	SAK1	P38990	1142 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YOR248W	YOR248W	ERP6	P53198	216 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YOR248W	YOR248W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YOR248W	YOR248W	SPO75	Q07798	868 aa		3.96	□□□□□ -1.78

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