RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRX1	YOL077C	PUS2	P53167	370 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	RPD3	P32561	433 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
BRX1	YOL077C	CHA4	P43634	648 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	RTA1	P53047	317 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	ENV7	Q12003	364 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
BRX1	YOL077C	SED4	P25365	1065 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	TIM23	P32897	222 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	ALG2	P43636	503 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	TAF1	P46677	1066 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	DAM1	P53267	343 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	NPC2	Q12408	173 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	YCR015C	P25616	317 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	CTS1	P29029	562 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	EMC3	P36039	253 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	NCS6	P53088	359 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	NUP82	P40368	713 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	PPM2	Q08282	695 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	UPC2	Q12151	913 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BRX1	YOL077C	DAL7	P21826	554 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	SAP190	P36123	1033 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	GYP8	P43570	497 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	HDA1	P53973	706 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	REH1	Q06709	432 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	PRC1	P00729	532 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	PHO8	P11491	566 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	RAD53	P22216	821 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	HCM1	P25364	564 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	BUD6	P41697	788 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	TAD1	P53065	400 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	SPC29	P33419	253 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	GDH3	P39708	457 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	SDP1	P40479	209 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	EXG2	P52911	562 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	CIT2	P08679	460 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	FBP1	P09201	348 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	THI4	P32318	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	DCG1	P32460	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	SHR5	P41912	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	ATP25	Q03153	612 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	MET7	Q08645	548 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	GUP2	Q08929	609 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	SWM1	Q12379	170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	KAR4	P25583	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	STE14	P32584	239 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	TRM2	P33753	639 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	CTF8	P38877	133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	ENB1	Q08299	606 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	GSY1	P23337	708 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	YCL002C	P25565	263 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	PPG1	P32838	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	YHR078W	P38799	552 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	DSS1	P39112	969 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	PHO23	P50947	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	RSC3	Q06639	885 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	PEX19	Q07418	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	NTO1	Q12311	748 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	DIF1	O13577	133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	PER1	P25625	357 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	ALY2	P47029	1046 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	AIM39	Q08223	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BRX1	YOL077C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BRX1	YOL077C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BRX1	YOL077C	PZF1	P39933	429 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BRX1	YOL077C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BRX1	YOL077C	NGG1	P32494	702 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BRX1	YOL077C	VHR1	P40522	640 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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