RNA–Protein interactions for RNA: YLL044W

YLL044W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YLL044W, Length 447 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL044W	YLL044W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	VPS30	Q02948	557 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	MDM12	Q92328	271 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	STE11	P23561	717 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	EMC1	P25574	760 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	SPC29	P33419	253 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	UBP5	P39944	805 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	GYP8	P43570	497 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	SPT20	P50875	604 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	RNH70	P53331	553 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	HDA1	P53973	706 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	UGO1	Q03327	502 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	REH1	Q06709	432 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	AIM44	Q99299	758 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	YLR358C	O13565	187 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	ALG12	P53730	551 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	UPC2	Q12151	913 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	RAD53	P22216	821 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	STE14	P32584	239 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	TOD6	P34219	525 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	NCS6	P53088	359 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	DOS2	P54858	310 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	YAP6	Q03935	383 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	GUP2	Q08929	609 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	THI4	P32318	326 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	MTC2	P34246	357 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	CTF8	P38877	133 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	SDP1	P40479	209 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	HXT16	P47185	567 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL044W	YLL044W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.74	not detected
YLL044W	YLL044W	FLR1	P38124	548 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	GCV2	P49095	1034 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	MET7	Q08645	548 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	GSY1	P23337	708 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	PPG1	P32838	368 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	PEX6	P33760	1030 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	YEL1	P34225	687 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	LST4	P34239	828 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	PLB1	P39105	664 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	CAF16	P43569	289 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	EXG2	P52911	562 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	TAD1	P53065	400 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	COG8	Q04632	607 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	THI21	Q08975	551 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	DAL7	P21826	554 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	SED4	P25365	1065 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	DCG1	P32460	244 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	RPD3	P32561	433 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	RSC3	Q06639	885 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	ESC8	Q08119	714 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	NTG2	Q08214	380 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	ENB1	Q08299	606 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	NPC2	Q12408	173 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	MEF1	P25039	761 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	CEP3	P40969	608 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	CDC9	P04819	755 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	MCD4	P36051	919 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	INO80	P53115	1489 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	SRD1	P09007	221 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	YCL002C	P25565	263 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	YCR015C	P25616	317 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	CTS1	P29029	562 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	YHR078W	P38799	552 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
YLL044W	YLL044W	MNN1	P39106	762 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	PUS2	P53167	370 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLL044W	YLL044W	TMA10	Q06177	86 aa		4.16	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.5 ms