RNA–Protein interactions for RNA: YJL218W

YJL218W, Transcript of Putative acetyltransferase, yeast

Gene YJL218W, Length 591 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL218W	YJL218W	SPT20	P50875	604 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	RTA1	P53047	317 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	TPO2	P53283	614 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	YPR196W	Q06595	470 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	CDA1	Q06702	301 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	RPO31	P04051	1460 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	NUP159	P40477	1460 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	TOD6	P34219	525 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	UBP5	P39944	805 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	YGR012W	P53206	393 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	TPO1	Q07824	586 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	CAN1	P04817	590 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	CDC11	P32458	415 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	PET10	P36139	283 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	YIR014W	P40570	242 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	YKE2	P52553	114 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	IOC4	Q04213	475 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	PDS5	Q04264	1277 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	LCD1	Q04377	747 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	CDC45	Q08032	650 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	PPM2	Q08282	695 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	GPB1	Q08886	897 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YJL218W	YJL218W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.33	□□□□□ -1.56	not detected
YJL218W	YJL218W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	HUL4	P40985	892 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	YAP6	Q03935	383 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	HMI1	Q12039	706 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	EMC1	P25574	760 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	CDC20	P26309	610 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	POA1	P38218	177 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	VPS62	P53285	467 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	RPN4	Q03465	531 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	RXT3	Q07458	294 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	ADY3	Q07732	790 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	ATG2	P53855	1592 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	ERR1	P0CX10	437 aa		5.31	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	ERR2	P0CX11	437 aa		5.31	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	HSF1	P10961	833 aa		5.31	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	GAL11	P19659	1081 aa		5.31	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	ROX1	P25042	368 aa		5.31	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	REC104	P33323	182 aa		5.31	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	PAF1	P38351	445 aa		5.31	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	BUD6	P41697	788 aa		5.31	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	YOR131C	Q12486	218 aa		5.31	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	SPE1	P08432	466 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.3	□□□□□ -1.56	not detected
YJL218W	YJL218W	RPC82	P32349	654 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	TIM23	P32897	222 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	5.3	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	DNF1	P32660	1571 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	DOM34	P33309	386 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	FLR1	P38124	548 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	MET12	P46151	657 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	IRC20	Q06554	1556 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	CIT2	P08679	460 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	RPD3	P32561	433 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	SCT1	P32784	759 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	TAF1	P46677	1066 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	YLR224W	Q05947	369 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	ENV7	Q12003	364 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YJL218W	YJL218W	ULS1	Q08562	1619 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	HIS5	P07172	385 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	STE13	P33894	931 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	LST4	P34239	828 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	CAT8	P39113	1433 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	GYP8	P43570	497 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	TMA10	Q06177	86 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	ESC8	Q08119	714 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	MMS1	Q06211	1407 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	PLB1	P39105	664 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	NUP82	P40368	713 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	HDA1	P53973	706 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	YLR358C	O13565	187 aa		5.25	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	CEP3	P40969	608 aa		5.25	□□□□□ -1.57
YJL218W	YJL218W	CHA4	P43634	648 aa		5.25	□□□□□ -1.57

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