RNA–Protein interactions for RNA: YGR102C

GTF1, Transcript of Subunit of the trimeric GatFAB AmidoTransferase(AdT) complex, yeast

Gene GTF1, Length 552 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GTF1	YGR102C	SNO2	P53823	222 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	LYP1	P32487	611 aa		5	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	TOD6	P34219	525 aa		5	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	VBA5	P36172	582 aa		5	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	FLR1	P38124	548 aa		5	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	PBY1	P38254	753 aa		5	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	PIK1	P39104	1066 aa		5	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	CNN1	P43618	361 aa		5	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	RIM8	P53179	542 aa		5	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	RSB1	Q08417	382 aa		5	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
GTF1	YGR102C	GRX7	P38068	203 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	RGD1	P38339	666 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	MPH1	P40562	993 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	PFD1	P46988	109 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	ERP6	P53198	216 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	SPO20	Q04359	397 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	NTG2	Q08214	380 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	ADR1	P07248	1323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	SOD2	P00447	233 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
GTF1	YGR102C	ARE1	P25628	610 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	YKL222C	P35995	705 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	HUL4	P40985	892 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	RTA1	P53047	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	TAF8	Q03750	510 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	EAF1	Q06337	982 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	USO1	P25386	1790 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
GTF1	YGR102C	GIP4	P39732	760 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
GTF1	YGR102C	UGO1	Q03327	502 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	PLB2	Q03674	706 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	SFP1	P32432	683 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	MXR1	P40029	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	TPO2	P53283	614 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	FOL1	P53848	824 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
GTF1	YGR102C	ROT1	Q03691	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	SGD1	Q06132	899 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	ESC2	Q06340	456 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	VMR1	P38735	1592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	PEX6	P33760	1030 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	MCM7	P38132	845 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	LAM1	P38851	1228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	MEF2	P39677	819 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	IML1	P47170	1584 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	SEC6	P32844	805 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
GTF1	YGR102C	BET3	P36149	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	GDH3	P39708	457 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	GEM1	P39722	662 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	PEX8	P53248	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	TFB2	Q02939	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	GAL10	P04397	699 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	CMP2	P14747	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	RFC5	P38251	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	ALR2	P43553	858 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	HNT2	P49775	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	SPT20	P50875	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	MAL11	P53048	616 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	ENV11	P53246	860 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	ATG13	Q06628	738 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	SVS1	Q12254	260 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	RKM4	Q12504	494 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	INO1	P11986	533 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	PMT3	P47190	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	HLJ1	P48353	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	GCN5	Q03330	439 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	RSM24	Q03976	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
GTF1	YGR102C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	SCT1	P32784	759 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	UGA2	P38067	497 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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