RNA–Protein interactions for RNA: YGL163C

RAD54, Transcript of DNA-dependent ATPase that stimulates strand exchange, yeast

Gene RAD54, Length 2,697 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD54	YGL163C	BYE1	P36106	594 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	XKS1	P42826	600 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	VPS53	P47061	822 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	MET13	P53128	600 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	NNF2	P53253	936 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	YGR130C	P53278	816 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	EAR1	Q03212	550 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	TAP42	Q04372	366 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	MSS18	P08593	268 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	AAC3	P18238	307 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	HNM1	P19807	563 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	RAD53	P22216	821 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	UGA4	P32837	571 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	RIB7	P33312	244 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	IXR1	P33417	597 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SEA4	P38164	1038 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	EMP65	P40085	556 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	QRI7	P43122	407 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SPO74	P45819	413 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	RPA14	P50106	137 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	ZIP2	P53061	704 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	TAF11	Q04226	346 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	PCL8	Q08966	492 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	RAD18	P10862	487 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	MER1	P16523	270 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	DAL7	P21826	554 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SPC110	P32380	944 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	KTR2	P33550	425 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	DCW1	P36091	449 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	FTH1	P38310	465 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	RAD55	P38953	406 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	AXL1	P40851	1208 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	PCL10	P53124	433 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	APP1	P53933	587 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	HIM1	Q06674	414 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	MRPL33	P20084	86 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SPE2	P21182	396 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	RPC53	P25441	422 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	MSH1	P25846	959 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SWC3	P31376	625 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	PAH1	P32567	862 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	BIT2	P38346	545 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	CKB2	P38930	258 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	MEF2	P39677	819 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	PSY2	P40164	858 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	AIM20	P40451	204 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	ENT3	P47160	408 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	BNI4	P53858	892 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SFB2	P53953	876 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	ARA2	Q04212	335 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SAM3	Q08986	587 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	PDX1	P16451	410 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	REC107	P21651	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
RAD54	YGL163C	SQT1	P35184	431 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SPC72	P39723	622 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SIT1	P39980	628 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	VHR1	P40522	640 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	IRC6	P43615	237 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	VPS4	P52917	437 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	AIM14	P53109	570 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SLD3	P53135	668 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	ERF2	Q06551	359 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	REX3	Q12090	404 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	RKM4	Q12504	494 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	FLP1	P03870	423 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SWI5	P08153	709 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	PET111	P08468	800 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	DAL80	P26343	269 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	DOM34	P33309	386 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SLC1	P33333	303 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	YEL1	P34225	687 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	YEL068C	P39977	110 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	SPO1	P53541	631 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	ARV1	Q06541	321 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAD54	YGL163C	GUD1	Q07729	489 aa		4.36	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 80.2 ms