RNA–Protein interactions for RNA: YBR187W

GDT1, Transcript of Protein of unknown function involved in calcium homeostasis, yeast

Gene GDT1, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GDT1	YBR187W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	KIN82	P25341	720 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	PRD1	P25375	712 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	GIP1	P38229	639 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	RSM26	P47141	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
GDT1	YBR187W	SUL2	Q12325	893 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	MRP7	P12687	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	SIR1	P21691	654 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	TFB1	P32776	642 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	CAB3	P36076	571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	UME6	P39001	836 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	ESL1	P40456	1118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	YGR122W	P53272	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	ISU1	Q03020	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	PCT1	P13259	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	DAL5	P15365	543 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	PDE1	P22434	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	SWC3	P31376	625 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	CCL1	P37366	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	GRX7	P38068	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	YHR202W	P38887	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	CSM2	P40465	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	YPS6	P40583	537 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	YGL081W	P53156	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	ENT2	Q05785	613 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	MCM16	Q12262	181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	DYN1	P36022	4092 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	ROX1	P25042	368 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	MIA40	P36046	403 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	YPP1	P46951	817 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	UBP15	P50101	1230 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	NMA2	P53204	395 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	RIF1	P29539	1916 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	SNF5	P18480	905 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	CSE2	P33308	149 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	OSH7	P38755	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	ATG3	P40344	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	YIR007W	P40566	764 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	YNL193W	P53870	558 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	RTT109	Q07794	436 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GDT1	YBR187W	RAD27	P26793	382 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	NDT80	P38830	627 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	MAM1	P40065	302 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	VTC4	P47075	721 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	ALT2	P52892	507 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	RIP1	P08067	215 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	MAS1	P10507	462 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	YHL026C	P38740	315 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	LSB6	P42951	607 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	GYP8	P43570	497 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	SUE1	Q06524	206 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	MPD2	Q99316	277 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	KIP1	P28742	1111 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	BIO2	P32451	375 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	ISF1	P32488	338 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	SAP190	P36123	1033 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	UBX7	P38349	436 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	NEM1	P38757	446 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	ROG3	P43602	733 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	DUG2	P38149	878 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	PCA1	P38360	1216 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	UBP5	P39944	805 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	DJP1	P40564	432 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GDT1	YBR187W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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