RNA–Protein interactions for RNA: YBL064C

PRX1, Transcript of Mitochondrial peroxiredoxin with thioredoxin peroxidase activity, yeast

Gene PRX1, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRX1	YBL064C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PRX1	YBL064C	ACE2	P21192	770 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PRX1	YBL064C	AEP2	P22136	580 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PRX1	YBL064C	RSC6	P25632	483 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PRX1	YBL064C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PRX1	YBL064C	BOI2	P39969	1040 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PRX1	YBL064C	NIT2	P47016	307 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PRX1	YBL064C	ALY2	P47029	1046 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PRX1	YBL064C	HXT16	P47185	567 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PRX1	YBL064C	NHX1	Q04121	633 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PRX1	YBL064C	YPR196W	Q06595	470 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PRX1	YBL064C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	DAL7	P21826	554 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	RPC82	P32349	654 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.08	□□□□□ -1.6	not detected
PRX1	YBL064C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	HFM1	P51979	1187 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	BUD9	P53226	547 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	MDG1	P53885	366 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	YDR338C	Q05497	695 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	OSW2	Q12202	724 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	PIF1	P07271	859 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	MIH1	P23748	554 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	MDL2	P33311	773 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	YGR153W	P48238	217 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	YNR014W	P53719	212 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	SDH1	Q00711	640 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	ATG16	Q03818	150 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	RSB1	Q08417	382 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	YVC1	Q12324	675 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	SSN2	P38931	1420 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	AI3	P03877	415 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	YCL002C	P25565	263 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	HSP78	P33416	811 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	MAC1	P35192	417 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	HSL7	P38274	827 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	TDA3	P38758	523 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	RET2	P43621	546 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	RSC58	Q07979	502 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	SVS1	Q12254	260 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	RMP1	Q12530	201 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	DIF1	O13577	133 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	DPB3	P27344	201 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	DAL3	P32459	195 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	DID4	P36108	232 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	YAP1801	P38856	637 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	MMM1	P41800	426 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	PIP2	P52960	996 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	UBX4	P54730	416 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	MET14	Q02196	202 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	ECM9	Q02202	377 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	ENA1	P13587	1091 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	NIC96	P34077	839 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	IES5	P40060	125 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	CIT3	P43635	486 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	YGR021W	P53212	290 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
PRX1	YBL064C	ENA2	Q01896	1091 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	YDL121C	Q07541	149 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	XYL2	Q07993	356 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	ENA5	Q12691	1091 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	GAL1	P04385	528 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	SAP190	P36123	1033 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	BIT2	P38346	545 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	IRC24	P40580	263 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	CEP3	P40969	608 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	SHR5	P41912	237 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	HDA1	P53973	706 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	PHM6	Q05637	104 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PRX1	YBL064C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PRX1	YBL064C	PTP2	P29461	750 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRX1	YBL064C	STE13	P33894	931 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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