RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000154553.1

Sft2d1-210, Transcript of Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sft2d1, Length 1,049 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Hoxd11P23813 323 aa28.36■■■□□ 2.13
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cyp19a1P28649 503 aa28.36■■■□□ 2.13
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Lrch1P62046 709 aa28.36■■■□□ 2.13
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Igflr1Q3U4N7 345 aa28.36■■■□□ 2.13
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa28.36■■■□□ 2.13
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Btaf1E9QAE3 1848 aa28.36■■■□□ 2.13
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cyp2d11P24457 504 aa28.35■■■□□ 2.13
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Chrna5Q2MKA5 467 aa28.34■■■□□ 2.13
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 GptQ8QZR5 496 aa28.34■■■□□ 2.13
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fam83gQ5SWY7 812 aa28.33■■■□□ 2.13
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 VwdeQ6DFV8 926 aa28.33■■■□□ 2.13
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 DaglaQ6WQJ1 1044 aa28.33■■■□□ 2.13
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 PdgfdQ925I7 370 aa28.33■■■□□ 2.13
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cops6O88545 324 aa28.32■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Glis2Q8VDL9 521 aa28.32■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Slc4a9E9PUP3 929 aa28.31■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 CanxP35564 591 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Aplp1Q03157 653 aa28.31■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Myh1Q5SX40 1942 aa28.31■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dcdc2bF7BCK0 340 aa28.3■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cyp7a1Q64505 503 aa28.3■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ppm1mQ8BU27 406 aa28.29■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Echdc1Q9D9V3 322 aa28.29■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ralbp1Q62172 648 aa28.28■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fkbp5Q64378 456 aa28.28■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ddx58Q6Q899 926 aa28.28■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 UvssaQ9D479 717 aa28.28■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 PnnO35691 725 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Map3k2Q61083 619 aa28.27■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Clca2Q8BG22 942 aa28.27■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Znf609Q8BZ47 1413 aa28.26■■■□□ 2.12
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa28.26■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 EappQ5BU09 281 aa28.25■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cwc25Q9DBF7 416 aa28.25■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Myoz2Q9JJW5 264 aa28.25■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 NudcO35685 332 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Vamp4O70480 141 aa28.24■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Podxl2Q8CAE9 603 aa28.24■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Oas2E9Q9A9 742 aa28.23■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 NfixP70257 488 aa28.23■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ttc14Q9CSP9 761 aa28.23■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ehd4Q9EQP2 541 aa28.23■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Adarb2Q9JI20 745 aa28.23■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Glt1d1A4FUP9 346 aa28.22■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Chl1P70232 1209 aa28.21■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Sv2bQ8BG39 683 aa28.21■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 NrdcQ8BHG1 1161 aa28.21■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Stard3nlQ9DCI3 235 aa28.21■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Lgr5Q9Z1P4 907 aa28.21■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ltn1Q6A009 1767 aa28.2■■■□□ 2.11
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Vsig10D3YX43 558 aa28.2■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 NmiO35309 314 aa28.2■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Eif6O55135 245 aa28.2■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ksr2Q3UVC0 959 aa28.2■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gas2l2Q5SSG4 860 aa28.2■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Slc51aQ8R000 340 aa28.2■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fam213aQ9CYH2 218 aa28.2■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dydc2Q9D3X8 139 aa28.2■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ly6iQ9WU67 134 aa28.2■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pappa2E9PZ87 1789 aa28.19■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Map9Q3TRR0 646 aa28.19■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ttc19Q8CC21 365 aa28.19■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gm6268A2A3U9 297 aa28.18■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Exoc6bA6H5Z3 810 aa28.18■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 BcanQ61361 883 aa28.18■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Kank1E9Q238 1360 aa28.18■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Greb1lB9EJV3 1913 aa28.18■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Skor1Q8BX46 964 aa28.17■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa28.17■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Trpm7Q923J1 1863 aa28.17■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Eddm13E9Q7F5 164 aa28.16■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rps8P62242 208 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Psmd1Q3TXS7 953 aa28.16■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Plekhg6Q8R0J1 787 aa28.16■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mical3Q8CJ19 1993 aa28.16■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Zbtb38Q3LR78 1197 aa28.15■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Best3Q6H1V1 669 aa28.15■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ripor2Q80U16 1078 aa28.15■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Kif2cQ922S8 721 aa28.15■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gdf11Q9Z1W4 405 aa28.15■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Map3k15A2AQW0 1331 aa28.15■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Tom1l2Q5SRX1 507 aa28.14■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Nrxn2E9Q7X7 1710 aa28.14■■■□□ 2.1
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 HlfQ8BW74 295 aa28.13■■■□□ 2.09
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Popdc2Q9ES82 367 aa28.13■■■□□ 2.09
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa28.13■■■□□ 2.09
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Myo3bQ1EG27 1305 aa28.13■■■□□ 2.09
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Anks4bQ8K3X6 423 aa28.12■■■□□ 2.09
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa28.11■■■□□ 2.09
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Trim34bJ3QNR8 485 aa28.11■■■□□ 2.09
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ccdc93Q7TQK5 629 aa28.11■■■□□ 2.09
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ccdc30Q8BVF4 654 aa28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 59.2 ms