Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.19■■■■■ 5.3
Chrna5Q2MKA5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Chrna5Q2MKA5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Chrna5Q2MKA5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
Chrna5Q2MKA5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
Chrna5Q2MKA5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
Chrna5Q2MKA5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Chrna5Q2MKA5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Chrna5Q2MKA5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Chrna5Q2MKA5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Chrna5Q2MKA5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
Chrna5Q2MKA5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Chrna5Q2MKA5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
Chrna5Q2MKA5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Chrna5Q2MKA5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Chrna5Q2MKA5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Chrna5Q2MKA5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Chrna5Q2MKA5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Chrna5Q2MKA5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Chrna5Q2MKA5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Chrna5Q2MKA5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Chrna5Q2MKA5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Chrna5Q2MKA5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Chrna5Q2MKA5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Chrna5Q2MKA5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Chrna5Q2MKA5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Chrna5Q2MKA5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Chrna5Q2MKA5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Chrna5Q2MKA5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Chrna5Q2MKA5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Chrna5Q2MKA5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Chrna5Q2MKA5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Chrna5Q2MKA5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Chrna5Q2MKA5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Chrna5Q2MKA5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Chrna5Q2MKA5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Chrna5Q2MKA5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Chrna5Q2MKA5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Chrna5Q2MKA5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Chrna5Q2MKA5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Chrna5Q2MKA5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Chrna5Q2MKA5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Chrna5Q2MKA5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Chrna5Q2MKA5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Chrna5Q2MKA5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Chrna5Q2MKA5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Chrna5Q2MKA5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Chrna5Q2MKA5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Chrna5Q2MKA5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Chrna5Q2MKA5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Chrna5Q2MKA5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Chrna5Q2MKA5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Chrna5Q2MKA5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Chrna5Q2MKA5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Chrna5Q2MKA5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Chrna5Q2MKA5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Chrna5Q2MKA5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Chrna5Q2MKA5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Chrna5Q2MKA5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Chrna5Q2MKA5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Chrna5Q2MKA5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Chrna5Q2MKA5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Chrna5Q2MKA5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Chrna5Q2MKA5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Chrna5Q2MKA5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Chrna5Q2MKA5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Chrna5Q2MKA5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Chrna5Q2MKA5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Chrna5Q2MKA5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Chrna5Q2MKA5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Chrna5Q2MKA5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Chrna5Q2MKA5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Chrna5Q2MKA5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Chrna5Q2MKA5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Chrna5Q2MKA5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Chrna5Q2MKA5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Chrna5Q2MKA5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Chrna5Q2MKA5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Chrna5Q2MKA5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Chrna5Q2MKA5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Chrna5Q2MKA5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Chrna5Q2MKA5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Chrna5Q2MKA5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Chrna5Q2MKA5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Chrna5Q2MKA5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Chrna5Q2MKA5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Chrna5Q2MKA5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Chrna5Q2MKA5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Chrna5Q2MKA5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Chrna5Q2MKA5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Chrna5Q2MKA5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Chrna5Q2MKA5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Chrna5Q2MKA5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Chrna5Q2MKA5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Chrna5Q2MKA5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Chrna5Q2MKA5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Chrna5Q2MKA5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Chrna5Q2MKA5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms