Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNF8

Tspoap1, Peripheral-type benzodiazepine receptor-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspoap1Q7TNF8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.91■■■■■ 5.26
Tspoap1Q7TNF8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Tspoap1Q7TNF8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Tspoap1Q7TNF8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
Tspoap1Q7TNF8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
Tspoap1Q7TNF8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Tspoap1Q7TNF8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
Tspoap1Q7TNF8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Tspoap1Q7TNF8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
Tspoap1Q7TNF8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Tspoap1Q7TNF8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
Tspoap1Q7TNF8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
Tspoap1Q7TNF8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Tspoap1Q7TNF8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Tspoap1Q7TNF8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Tspoap1Q7TNF8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Tspoap1Q7TNF8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Tspoap1Q7TNF8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Tspoap1Q7TNF8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Tspoap1Q7TNF8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Tspoap1Q7TNF8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Tspoap1Q7TNF8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Tspoap1Q7TNF8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Tspoap1Q7TNF8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Tspoap1Q7TNF8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Tspoap1Q7TNF8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Tspoap1Q7TNF8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Tspoap1Q7TNF8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Tspoap1Q7TNF8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Tspoap1Q7TNF8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Tspoap1Q7TNF8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Tspoap1Q7TNF8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Tspoap1Q7TNF8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Tspoap1Q7TNF8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Tspoap1Q7TNF8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Tspoap1Q7TNF8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Tspoap1Q7TNF8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Tspoap1Q7TNF8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Tspoap1Q7TNF8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Tspoap1Q7TNF8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Tspoap1Q7TNF8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Tspoap1Q7TNF8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Tspoap1Q7TNF8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Tspoap1Q7TNF8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Tspoap1Q7TNF8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Tspoap1Q7TNF8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Tspoap1Q7TNF8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Tspoap1Q7TNF8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Tspoap1Q7TNF8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Tspoap1Q7TNF8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Tspoap1Q7TNF8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Tspoap1Q7TNF8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Tspoap1Q7TNF8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Tspoap1Q7TNF8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Tspoap1Q7TNF8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Tspoap1Q7TNF8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Tspoap1Q7TNF8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Tspoap1Q7TNF8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Tspoap1Q7TNF8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Tspoap1Q7TNF8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Tspoap1Q7TNF8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Tspoap1Q7TNF8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Tspoap1Q7TNF8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Tspoap1Q7TNF8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Tspoap1Q7TNF8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Tspoap1Q7TNF8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Tspoap1Q7TNF8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Tspoap1Q7TNF8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Tspoap1Q7TNF8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Tspoap1Q7TNF8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Tspoap1Q7TNF8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Tspoap1Q7TNF8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Tspoap1Q7TNF8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Tspoap1Q7TNF8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Tspoap1Q7TNF8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Tspoap1Q7TNF8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Tspoap1Q7TNF8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Tspoap1Q7TNF8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Tspoap1Q7TNF8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tspoap1Q7TNF8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Tspoap1Q7TNF8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Tspoap1Q7TNF8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Tspoap1Q7TNF8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Tspoap1Q7TNF8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
Tspoap1Q7TNF8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tspoap1Q7TNF8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Tspoap1Q7TNF8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Tspoap1Q7TNF8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Tspoap1Q7TNF8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Tspoap1Q7TNF8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Tspoap1Q7TNF8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Tspoap1Q7TNF8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Tspoap1Q7TNF8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Tspoap1Q7TNF8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Tspoap1Q7TNF8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Tspoap1Q7TNF8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Tspoap1Q7TNF8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Tspoap1Q7TNF8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Tspoap1Q7TNF8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Tspoap1Q7TNF8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms