Protein–RNA interactions for Protein: E9QAE3

Btaf1, B-TFIID TATA-box-binding protein-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btaf1E9QAE3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.23■■■■■ 5.31
Btaf1E9QAE3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
Btaf1E9QAE3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Btaf1E9QAE3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
Btaf1E9QAE3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
Btaf1E9QAE3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
Btaf1E9QAE3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Btaf1E9QAE3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Btaf1E9QAE3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Btaf1E9QAE3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Btaf1E9QAE3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Btaf1E9QAE3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
Btaf1E9QAE3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Btaf1E9QAE3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Btaf1E9QAE3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Btaf1E9QAE3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Btaf1E9QAE3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Btaf1E9QAE3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Btaf1E9QAE3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Btaf1E9QAE3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Btaf1E9QAE3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Btaf1E9QAE3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Btaf1E9QAE3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Btaf1E9QAE3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Btaf1E9QAE3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Btaf1E9QAE3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Btaf1E9QAE3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Btaf1E9QAE3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Btaf1E9QAE3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Btaf1E9QAE3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Btaf1E9QAE3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Btaf1E9QAE3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Btaf1E9QAE3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Btaf1E9QAE3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Btaf1E9QAE3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Btaf1E9QAE3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Btaf1E9QAE3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Btaf1E9QAE3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Btaf1E9QAE3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Btaf1E9QAE3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Btaf1E9QAE3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Btaf1E9QAE3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Btaf1E9QAE3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Btaf1E9QAE3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Btaf1E9QAE3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Btaf1E9QAE3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Btaf1E9QAE3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Btaf1E9QAE3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Btaf1E9QAE3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
Btaf1E9QAE3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Btaf1E9QAE3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Btaf1E9QAE3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Btaf1E9QAE3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Btaf1E9QAE3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Btaf1E9QAE3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Btaf1E9QAE3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Btaf1E9QAE3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Btaf1E9QAE3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Btaf1E9QAE3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Btaf1E9QAE3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Btaf1E9QAE3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Btaf1E9QAE3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Btaf1E9QAE3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Btaf1E9QAE3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Btaf1E9QAE3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Btaf1E9QAE3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Btaf1E9QAE3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Btaf1E9QAE3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Btaf1E9QAE3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Btaf1E9QAE3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Btaf1E9QAE3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Btaf1E9QAE3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Btaf1E9QAE3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Btaf1E9QAE3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Btaf1E9QAE3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Btaf1E9QAE3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Btaf1E9QAE3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Btaf1E9QAE3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Btaf1E9QAE3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Btaf1E9QAE3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Btaf1E9QAE3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Btaf1E9QAE3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Btaf1E9QAE3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Btaf1E9QAE3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Btaf1E9QAE3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Btaf1E9QAE3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Btaf1E9QAE3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Btaf1E9QAE3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Btaf1E9QAE3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Btaf1E9QAE3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Btaf1E9QAE3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Btaf1E9QAE3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Btaf1E9QAE3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Btaf1E9QAE3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Btaf1E9QAE3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Btaf1E9QAE3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Btaf1E9QAE3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Btaf1E9QAE3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Btaf1E9QAE3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Btaf1E9QAE3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms