Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48■■■■■ 5.27
NfixP70257 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
NfixP70257 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
NfixP70257 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
NfixP70257 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
NfixP70257 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
NfixP70257 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NfixP70257 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
NfixP70257 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
NfixP70257 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
NfixP70257 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
NfixP70257 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
NfixP70257 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NfixP70257 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
NfixP70257 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
NfixP70257 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NfixP70257 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
NfixP70257 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
NfixP70257 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
NfixP70257 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NfixP70257 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NfixP70257 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NfixP70257 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NfixP70257 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NfixP70257 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
NfixP70257 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38■■■■□ 3.67
NfixP70257 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NfixP70257 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NfixP70257 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NfixP70257 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NfixP70257 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NfixP70257 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NfixP70257 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
NfixP70257 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NfixP70257 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NfixP70257 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NfixP70257 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NfixP70257 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NfixP70257 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NfixP70257 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
NfixP70257 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NfixP70257 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NfixP70257 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
NfixP70257 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
NfixP70257 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NfixP70257 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
NfixP70257 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NfixP70257 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NfixP70257 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NfixP70257 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NfixP70257 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
NfixP70257 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
NfixP70257 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NfixP70257 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NfixP70257 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NfixP70257 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NfixP70257 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NfixP70257 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NfixP70257 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NfixP70257 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NfixP70257 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NfixP70257 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NfixP70257 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
NfixP70257 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NfixP70257 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NfixP70257 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NfixP70257 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NfixP70257 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
NfixP70257 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NfixP70257 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NfixP70257 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NfixP70257 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NfixP70257 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
NfixP70257 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NfixP70257 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NfixP70257 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
NfixP70257 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NfixP70257 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NfixP70257 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NfixP70257 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NfixP70257 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NfixP70257 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NfixP70257 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NfixP70257 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NfixP70257 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NfixP70257 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NfixP70257 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NfixP70257 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NfixP70257 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NfixP70257 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
NfixP70257 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NfixP70257 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NfixP70257 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NfixP70257 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NfixP70257 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NfixP70257 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NfixP70257 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NfixP70257 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NfixP70257 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NfixP70257 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms