RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	ACM1	Q08981	209 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	HMI1	Q12039	706 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	ARE1	P25628	610 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	ERP6	P53198	216 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	ATG13	Q06628	738 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	UGA2	P38067	497 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	ALR2	P43553	858 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	PFD1	P46988	109 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	TPO2	P53283	614 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	FLC1	Q08967	793 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	AIM21	P40563	679 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	MSC2	Q03455	724 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	YDR306C	Q06640	478 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	ACE2	P21192	770 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	SLA2	P33338	968 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	RPN4	Q03465	531 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	UBX5	Q06682	500 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	AIM44	Q99299	758 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	CIT1	P00890	479 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	BI4	P03879	638 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	PPH3	P32345	308 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	CHS7	P38843	316 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	HUL4	P40985	892 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	OSW7	P43611	510 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL171C	YNL171C	SCT1	P32784	759 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.71	□□□□□ -1.5	not detected
YNL171C	YNL171C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	CCC2	P38995	1004 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.71	□□□□□ -1.5	not detected
YNL171C	YNL171C	HFM1	P51979	1187 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	KIN4	Q01919	800 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	CDC11	P32458	415 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	DCG1	P32460	244 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	PLB1	P39105	664 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	CTF4	Q01454	927 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	ADE8	P04161	214 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	GAL11	P19659	1081 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	MSS4	P38994	779 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	MND2	P40577	368 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	TPO1	Q07824	586 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	CAN1	P04817	590 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	YKL151C	P36059	337 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	RRT14	P40470	206 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	BUD6	P41697	788 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	XYL2	Q07993	356 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	CIT2	P08679	460 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	YPT53	P36019	220 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	YRO2	P38079	344 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	YBR284W	P38150	797 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	TAF8	Q03750	510 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	YLL058W	Q12198	575 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	RAD53	P22216	821 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	SIT1	P39980	628 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	NUP82	P40368	713 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	ADY3	Q07732	790 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	MDM38	Q08179	573 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	PPG1	P32838	368 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	TIM23	P32897	222 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	MTC3	P53077	123 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	RNH70	P53331	553 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.65	□□□□□ -1.5	not detected
YNL171C	YNL171C	PPM2	Q08282	695 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	YPR071W	Q12346	211 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YNL171C	YNL171C	ZRG8	P40021	1076 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YNL171C	YNL171C	MET12	P46151	657 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YNL171C	YNL171C	SRT1	Q03175	343 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YNL171C	YNL171C	LCD1	Q04377	747 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YNL171C	YNL171C	OSW2	Q12202	724 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YNL171C	YNL171C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
YNL171C	YNL171C	POA1	P38218	177 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YNL171C	YNL171C	RTA1	P53047	317 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YNL171C	YNL171C	YLR125W	Q12138	136 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YNL171C	YNL171C	HIS5	P07172	385 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YNL171C	YNL171C	ERR1	P0CX10	437 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YNL171C	YNL171C	ERR2	P0CX11	437 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YNL171C	YNL171C	PHO8	P11491	566 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YNL171C	YNL171C	TOP3	P13099	656 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YNL171C	YNL171C	ENA1	P13587	1091 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YNL171C	YNL171C	FUN30	P31380	1131 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YNL171C	YNL171C	PET10	P36139	283 aa		5.62	□□□□□ -1.51

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.2 ms