RNA–Protein interactions for RNA: YMR053C

STB2, Transcript of Protein that interacts with Sin3p in a two-hybrid assay, yeast

Gene STB2, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB2	YMR053C	YPR084W	Q06821	456 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB2	YMR053C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STB2	YMR053C	KAR3	P17119	729 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	AAC3	P18238	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	AEP2	P22136	580 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
STB2	YMR053C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PAH1	P32567	862 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	DLD1	P32891	587 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	MRP8	P35719	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SPC72	P39723	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	QRI7	P43122	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PCL10	P53124	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	GCR1	P07261	785 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PPQ1	P32945	549 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	CCL1	P37366	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	CTM1	P38818	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	GYP7	P48365	746 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	HOP2	P53187	214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	DAL4	Q04895	635 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	TAH18	Q12181	623 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	RAM1	P22007	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	MSH3	P25336	1018 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	MRE11	P32829	692 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PSY4	P38193	441 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PSY2	P40164	858 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	CIT3	P43635	486 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	GUP1	P53154	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
STB2	YMR053C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	CBP3	P21560	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	DIT1	P21623	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	LYP1	P32487	611 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	ISC10	P32645	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	VBA5	P36172	582 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SEA4	P38164	1038 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SIT1	P39980	628 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SKP2	P42843	763 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	TUB4	P53378	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	TIM10	P87108	93 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SEC5	P89102	971 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	YPL109C	Q02981	657 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	MLH2	Q07980	695 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PDX1	P16451	410 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PBY1	P38254	753 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	FTH1	P38310	465 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PEX18	P38855	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	MAD3	P47074	515 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	DSL1	P53847	754 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	YNL115C	P53925	644 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SAP30	P38429	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	RMD8	P43620	662 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	NUP84	P52891	726 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	NUT1	P53114	1132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PUS6	P53294	404 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	CAB1	Q04430	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	BSC2	Q05611	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
STB2	YMR053C	ENT1	Q12518	454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	HSF1	P10961	833 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PHO81	P17442	1178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	BYE1	P36106	594 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	YLF2	P38746	405 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SPT8	P38915	602 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	VPS9	P54787	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	HAP5	Q02516	242 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	EAR1	Q03212	550 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PHM7	Q12252	991 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PMS1	P14242	873 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	COY1	P34237	679 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	MDJ1	P35191	511 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	MTH1	P35198	433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected

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