RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	TRS33	Q99394	268 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	AUS1	Q08409	1394 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	SPT7	P35177	1332 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	CIT1	P00890	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	IDI1	P15496	288 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	MEF1	P25039	761 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	YKL100C	P34248	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	NDE1	P40215	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	MEP1	P40260	492 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	DJP1	P40564	432 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	VTC2	P43585	828 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	YGR122W	P53272	402 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	DSE4	P53753	1117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	ERO1	Q03103	563 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	OXR1	Q08952	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	PXA2	P34230	853 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	YKL133C	P36066	463 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	DYS1	P38791	387 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	NPR2	P39923	615 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	SPC105	P53148	917 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	HIM1	Q06674	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	GAS5	Q08193	484 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	FLC1	Q08967	793 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	FKS3	Q04952	1785 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	APC1	P53886	1748 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	PIF1	P07271	859 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	STE5	P32917	917 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	VPS35	P34110	944 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	SAF1	P38352	637 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	YBR287W	P38355	427 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	CAJ1	P39101	391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	SAP185	P40856	1058 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	ROM1	P53046	1155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	AOS1	Q06624	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	NUP145	P49687	1317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	COB	P00163	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	CYC8	P14922	966 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	ACE2	P21192	770 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	YKR075C	P36155	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	RIM4	P38741	713 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	TMA108	P40462	946 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	YJR120W	P47157	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	TYW3	P53177	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	RSC1	P53236	928 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	BTN2	P53286	410 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	GRX3	Q03835	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	VTI1	Q04338	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	IRC3	Q06683	689 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	SPO75	Q07798	868 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	NTG2	Q08214	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	CEX1	Q12453	761 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	SIR4	P11978	1358 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	HOM3	P10869	527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	CHS2	P14180	963 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
KTR2	YKR061W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	GIP1	P38229	639 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	RXT2	P38255	430 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	YHR218W	P38899	603 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	GEM1	P39722	662 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	GIP2	P40036	548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	LEM3	P42838	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	AVT1	P47082	602 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	PIP2	P52960	996 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	YGR016W	P53209	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	UFD2	P54860	961 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	ATG13	Q06628	738 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	MRPL33	P20084	86 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	PRI2	P20457	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	CHS3	P29465	1165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KTR2	YKR061W	ELM1	P32801	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.5 ms