RNA–Protein interactions for RNA: YKL062W

MSN4, Transcript of Stress-responsive transcriptional activator, yeast

Gene MSN4, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSN4	YKL062W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	YKL151C	P36059	337 aa		5	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	AVT1	P47082	602 aa		5	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	ENT2	Q05785	613 aa		5	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	SPO75	Q07798	868 aa		5	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	YDL177C	Q12257	170 aa		5	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	RAD4	P14736	754 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	NFU1	P32860	256 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	MTC3	P53077	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	FOL1	P53848	824 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	APL1	P27351	700 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	MRPL22	P53881	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	FMP25	Q08023	583 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	DAL5	P15365	543 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
MSN4	YKL062W	PFD1	P46988	109 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	SNO2	P53823	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	NUP82	P40368	713 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	HFM1	P51979	1187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	EAF1	Q06337	982 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	MDM38	Q08179	573 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	PPM2	Q08282	695 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	ERP4	Q12450	207 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	TIM54	P47045	478 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	HUL5	P53119	910 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	PEX8	P53248	589 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MSN4	YKL062W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	PPH3	P32345	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	ALR2	P43553	858 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	IES1	P43579	692 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	ERP6	P53198	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	OSW2	Q12202	724 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	ADE8	P04161	214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	CMP2	P14747	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	SRM1	P21827	482 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	RPN12	P32496	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	SRT1	Q03175	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	SGD1	Q06132	899 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	CDC11	P32458	415 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	NIT1	P40447	199 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	MSC2	Q03455	724 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
MSN4	YKL062W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	RNQ1	P25367	405 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	ARE1	P25628	610 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	ELM1	P32801	640 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	TIM23	P32897	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	PAF1	P38351	445 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	GIC1	P38785	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	CDA2	Q06703	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	GAL10	P04397	699 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	MRC1	P25588	1096 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	LAM1	P38851	1228 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	YAP1801	P38856	637 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	SIT1	P39980	628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	ROT1	Q03691	256 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	XYL2	Q07993	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	FLC1	Q08967	793 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	FUN30	P31380	1131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	YRO2	P38079	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	YGR021W	P53212	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	PLB2	Q03674	706 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	CIT1	P00890	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	PHO8	P11491	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	MAL31	P38156	614 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	CCC2	P38995	1004 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	MEF2	P39677	819 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSN4	YKL062W	HOS4	P40480	1083 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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