RNA–Protein interactions for RNA: YJL192C

SOP4, Transcript of ER-membrane protein, yeast

Gene SOP4, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOP4	YJL192C	DNF3	Q12674	1656 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SOP4	YJL192C	DUT1	P33317	147 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	GIP4	P39732	760 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
SOP4	YJL192C	ROT1	Q03691	256 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	RAV1	P47104	1357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	NUP192	P47054	1683 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	SOD2	P00447	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	BAS1	P22035	811 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	MXR1	P40029	184 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	YSP2	Q06681	1438 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	IML1	P47170	1584 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	CMP2	P14747	604 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	RAD27	P26793	382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	ASF1	P32447	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	PET112	P33893	541 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	PAF1	P38351	445 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	HNT2	P49775	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	SPT20	P50875	604 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	EEB1	Q02891	456 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	SGD1	Q06132	899 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	GAL10	P04397	699 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	PCT1	P13259	424 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	SRM1	P21827	482 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	SCT1	P32784	759 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	LAM1	P38851	1228 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	PLB2	Q03674	706 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
SOP4	YJL192C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	SVS1	Q12254	260 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	MET5	P47169	1442 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	RFC5	P38251	354 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	GCN5	Q03330	439 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	GNT1	Q12096	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	CDC34	P14682	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	MSP1	P28737	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	LYP1	P32487	611 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	UGA2	P38067	497 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	MEF2	P39677	819 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	RMD1	Q03441	430 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	RSM24	Q03976	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	ESC2	Q06340	456 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
SOP4	YJL192C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	PDR11	P40550	1411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	VMR1	P38735	1592 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	BI4	P03879	638 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	INO1	P11986	533 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	APL1	P27351	700 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SOP4	YJL192C	BUD3	P25558	1636 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	TYW3	P53177	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
SOP4	YJL192C	CTS1	P29029	562 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	SLA2	P33338	968 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	YGL176C	P46945	554 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	DUS4	Q06063	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	ACM1	Q08981	209 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	USO1	P25386	1790 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	ACE2	P21192	770 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	PNT1	P38969	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	MET10	P39692	1035 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	GCV2	P49095	1034 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	XYL2	Q07993	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	DRS2	P39524	1355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	YKL107W	P34251	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SOP4	YJL192C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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