RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SNX4	YJL036W	OAR1	P35731	278 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNX4	YJL036W	MOH1	P38191	138 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNX4	YJL036W	PNT1	P38969	423 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNX4	YJL036W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SNX4	YJL036W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SNX4	YJL036W	HIS5	P07172	385 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	TIM54	P47045	478 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	EXG2	P52911	562 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	RAD4	P14736	754 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	BUD6	P41697	788 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	CHA4	P43634	648 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	HUL5	P53119	910 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	ENA1	P13587	1091 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	TSR4	P25040	408 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	OPI10	Q08202	246 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	AIM39	Q08223	395 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	OSW2	Q12202	724 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	LYP1	P32487	611 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	MTC3	P53077	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	YAP1801	P38856	637 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	NUP82	P40368	713 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	YGR053C	P53234	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	XYL2	Q07993	356 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	RKM4	Q12504	494 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	TIM23	P32897	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	DUT1	P33317	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	YKL069W	P36088	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	MNN1	P39106	762 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	UBA2	P52488	636 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	YGR012W	P53206	393 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	PHO8	P11491	566 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	YJR008W	P47085	338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	TYW3	P53177	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNX4	YJL036W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
SNX4	YJL036W	INO1	P11986	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	YKL107W	P34251	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	TOM20	P35180	183 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	ATG19	P35193	415 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	YJR142W	P47173	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	CDA1	Q06702	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	SPO75	Q07798	868 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	MDM38	Q08179	573 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	ENB1	Q08299	606 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	LAS17	Q12446	633 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	TOP1	P04786	769 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	SPE1	P08432	466 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	HSF1	P10961	833 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	GAL11	P19659	1081 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	THI4	P32318	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	CCC2	P38995	1004 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	YGL176C	P46945	554 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	RTS3	P53289	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	EEB1	Q02891	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	SPO20	Q04359	397 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	FLC1	Q08967	793 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	FUN30	P31380	1131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	YKL151C	P36059	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	YBR184W	P38299	523 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	YGL081W	P53156	320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
SNX4	YJL036W	SRT1	Q03175	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	SRP101	P32916	621 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	BUL1	P48524	976 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	NCS6	P53088	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	UBX5	Q06682	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNX4	YJL036W	GUP2	Q08929	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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