RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	PHO23	P50947	330 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	STE11	P23561	717 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	NPP1	P25353	742 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	HCM1	P25364	564 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	MRP8	P35719	219 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	INO80	P53115	1489 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	SPE1	P08432	466 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	HSF1	P10961	833 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	PPH3	P32345	308 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	AFR1	P33304	620 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	PBY1	P38254	753 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	YBR184W	P38299	523 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	CHA4	P43634	648 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	ERT1	P38140	529 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	CCC2	P38995	1004 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	YER158C	P40095	573 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	IRR1	P40541	1150 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	GYP7	P48365	746 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	YPR196W	Q06595	470 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	NTO1	Q12311	748 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	KCS1	Q12494	1050 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	DCG1	P32460	244 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	TRM2	P33753	639 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	YRO2	P38079	344 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	PFD1	P46988	109 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	SUN4	P53616	420 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	ADE8	P04161	214 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	EXG2	P52911	562 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	NCS6	P53088	359 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	NPC2	Q12408	173 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	SWR1	Q05471	1514 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	RPC82	P32349	654 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	YKE2	P52553	114 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	FMP25	Q08023	583 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	PUS9	Q12069	462 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PEX18	YHR160C	YBR284W	P38150	797 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	SIT1	P39980	628 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	ALR2	P43553	858 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	MSE1	P48525	536 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	UBX5	Q06682	500 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	PNS1	Q12412	539 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	LAS17	Q12446	633 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	TOK1	P40310	691 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	SLI1	P53304	468 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	UPC2	Q12151	913 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	YPR071W	Q12346	211 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	KAR4	P25583	335 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	RPD3	P32561	433 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	ATG19	P35193	415 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	MSS4	P38994	779 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	KIN4	Q01919	800 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	STE13	P33894	931 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	AIM21	P40563	679 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	TPO2	P53283	614 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	LCD1	Q04377	747 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	EAF1	Q06337	982 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	RAD4	P14736	754 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	STE14	P32584	239 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	IOC3	P43596	787 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	SGS1	P35187	1447 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	SED4	P25365	1065 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	ARE1	P25628	610 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	SPO75	Q07798	868 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PEX18	YHR160C	TOP3	P13099	656 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	REC104	P33323	182 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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