RNA–Protein interactions for RNA: YGR102C

GTF1, Transcript of Subunit of the trimeric GatFAB AmidoTransferase(AdT) complex, yeast

Gene GTF1, Length 552 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GTF1	YGR102C	YJR142W	P47173	342 aa		5.11	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	TYW3	P53177	273 aa		5.11	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	RTT10	Q08924	1013 aa		5.11	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	PTC5	Q12511	572 aa		5.11	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	GCR1	P07261	785 aa		5.1	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	PHO8	P11491	566 aa		5.1	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	YSP2	Q06681	1438 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	TIM23	P32897	222 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	THI80	P35202	319 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	YKL069W	P36088	180 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	HXT13	P39924	564 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	GNP1	P48813	663 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	HXT17	P53631	564 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	MRPL22	P53881	309 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	HXT15	P54854	567 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	FLC1	Q08967	793 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	YLR125W	Q12138	136 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GTF1	YGR102C	HAP1	P0CE41	1502 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	RSC58	Q07979	502 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	MKK2	P32491	506 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	SWE1	P32944	819 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	YFL054C	P43549	646 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	SIW14	P53965	281 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	EEB1	Q02891	456 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	MRL1	Q06815	381 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	SRB8	P25648	1427 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	TAF13	P11747	167 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	SPO75	Q07798	868 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	SPO21	Q12411	609 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	SNF5	P18480	905 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	BAS1	P22035	811 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	AGP1	P25376	633 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	RAD27	P26793	382 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	THI4	P32318	326 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	BAP2	P38084	609 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	YBR184W	P38299	523 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	TPM2	P40414	161 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	TAF1	P46677	1066 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	DNM1	P54861	757 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	COQ4	O13525	335 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	GAL11	P19659	1081 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	SRM1	P21827	482 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	STE5	P32917	917 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	YEN1	P40028	759 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	YGR125W	P53273	1036 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	TNA1	P53322	534 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	OSH2	Q12451	1283 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	CIT1	P00890	479 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	SPS1	P08458	490 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	ERR1	P0CX10	437 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	ERR2	P0CX11	437 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	MRP8	P35719	219 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	SHE9	Q04172	456 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	FMP25	Q08023	583 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GTF1	YGR102C	CAN1	P04817	590 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	YER152C	P10356	443 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	MLS1	P30952	554 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	IRR1	P40541	1150 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	VPS72	Q03388	795 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.02	□□□□□ -1.61	not detected
GTF1	YGR102C	ESC8	Q08119	714 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	YOL057W	Q08225	711 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	YPL260W	Q08977	551 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	YPL277C	Q08989	487 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	YBT1	P32386	1661 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	MRC1	P25588	1096 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	YCR015C	P25616	317 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	MSH2	P25847	964 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	RER2	P35196	286 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	CCZ1	P38273	704 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	PAF1	P38351	445 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	ENT3	P47160	408 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GTF1	YGR102C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61

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