RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	RAD53	P22216	821 aa		5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	GSY1	P23337	708 aa		5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	VPS45	P38932	577 aa		5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	CIT3	P43635	486 aa		5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	TOS3	P43637	560 aa		5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	TRS85	P46944	698 aa		5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	COS5	P47187	383 aa		5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	YGR021W	P53212	290 aa		5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	LSB1	P53281	241 aa		5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	MFM1	Q02783	413 aa		5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	FUS2	Q05670	677 aa		5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	ADY4	Q05955	493 aa		5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	TCO89	Q08921	799 aa		5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	YOR223W	Q12015	292 aa		5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	MED1	Q12321	566 aa		5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	GRX6	Q12438	231 aa		5.28	□□□□□ -1.56
UBX7	YBR273C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	YLR464W	P0CX17	216 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	SEC8	P32855	1065 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	NIP100	P33420	868 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	KTR2	P33550	425 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	SQT1	P35184	431 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	YSW1	P38280	609 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	YEL076C	P39971	216 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	HXT8	P40886	569 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	EMP47	P43555	445 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	RPC17	P47076	161 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	VID30	P53076	958 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	NSG2	P53898	299 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	YML119W	Q03208	357 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	SFH1	Q06168	426 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	YLH47	Q06493	454 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	YLR001C	Q07895	862 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	MLH2	Q07980	695 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	ZRT2	Q12436	422 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	TUP1	P16649	713 aa		5.26	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	SMC1	P32908	1225 aa		5.26	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	JNM1	P36224	373 aa		5.26	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	ISW1	P38144	1129 aa		5.26	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	RCK2	P38623	610 aa		5.26	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	BIM1	P40013	344 aa		5.26	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	YFL034W	P43564	1073 aa		5.26	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	KAP114	P53067	1004 aa		5.26	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	URH1	Q04179	340 aa		5.26	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	YPL216W	Q08964	1102 aa		5.26	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	ACE2	P21192	770 aa		5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	CHS3	P29465	1165 aa		5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	XRS2	P33301	854 aa		5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	BLI1	P35727	113 aa		5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	PPS1	P38148	807 aa		5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	SIP3	P38717	1229 aa		5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	GAA1	P39012	614 aa		5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	FIG4	P42837	879 aa		5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	GUP1	P53154	560 aa		5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	YMR018W	Q04364	514 aa		5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	ECI1	Q05871	280 aa		5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	SIL1	Q08199	421 aa		5.25	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	SWI6	P09959	803 aa		5.24	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	PCK1	P10963	549 aa		5.24	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	CST26	P38226	397 aa		5.24	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	KIC1	P38692	1080 aa		5.24	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	SAK1	P38990	1142 aa		5.24	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	SPC72	P39723	622 aa		5.24	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	UBP5	P39944	805 aa		5.24	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	PSY2	P40164	858 aa		5.24	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	MMM1	P41800	426 aa		5.24	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	TAD1	P53065	400 aa		5.24	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	ESBP6	P53918	673 aa		5.24	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	YPL062W	Q02781	134 aa		5.24	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	AIM33	Q04516	312 aa		5.24	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		5.24	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	ADH4	P10127	382 aa		5.23	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	ERG11	P10614	530 aa		5.23	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	KIN1	P13185	1064 aa		5.23	□□□□□ -1.57
UBX7	YBR273C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57

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