RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 SNX21Q969T3 373 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 TERF1P54274 439 aa22.83■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.83■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 MYL6BP14649 208 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 TTC22Q5TAA0 569 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 SSH3Q8TE77 659 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 NGLY1Q96IV0 654 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 PAPPAQ13219 1627 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 POLA2Q14181 598 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 GBP4Q96PP9 640 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 AFF2P51816 1311 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 POTEAQ6S8J7 498 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 LINS1Q8NG48 757 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 DISP2A7MBM2 1401 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 COPS6Q7L5N1 327 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 CDC45O75419 566 aa22.77■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 TNS2Q63HR2 1409 aa22.77■■□□□ 1.24
SPNS1-204ENST00000352260 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 SRGAP3O43295 1099 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 IGKV5-2P06315 115 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 UTYO14607 1347 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 ERBB4Q15303 1308 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 ILDR2Q71H61 639 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 GRM8O00222 908 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 RAB11FIP3O75154 756 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 PDE1AP54750 535 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 MTX1Q13505 466 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 ARXQ96QS3 562 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 USP21Q9UK80 565 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 SDSP20132 328 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 MAP7D2Q96T17 732 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 MYD88Q99836 296 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 NBPF26B4DH59 902 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 NBPF14Q5TI25 921 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 NBPF15Q8N660 670 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 SUCLG2Q96I99 432 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 SLIT2O94813 1529 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
SPNS1-204ENST00000352260 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 HS1BP3Q53T59 392 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 KAZALD1Q96I82 304 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 NRAPQ86VF7 1730 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 MX1P20591 662 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 GCKRQ14397 625 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 PIGBQ92521 554 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 STAP2Q9UGK3 403 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 OFD1O75665 1012 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 A1BGP04217 495 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 EXOC5O00471 708 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 ITGB4P16144 1822 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.65■■□□□ 1.22
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