RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298466.9

SOHLH1-201, Transcript of spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOHLH1, Length 1,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF428Q96B54 188 aa28.46■■■□□ 2.15
SOHLH1-201ENST00000298466 BCAR3O75815 825 aa28.46■■■□□ 2.15
SOHLH1-201ENST00000298466 HLFQ16534 295 aa28.46■■■□□ 2.15
SOHLH1-201ENST00000298466 QSER1Q2KHR3 1735 aa28.45■■■□□ 2.15
SOHLH1-201ENST00000298466 FLIIQ13045 1269 aa28.45■■■□□ 2.14
SOHLH1-201ENST00000298466 FKBP8Q14318 412 aa28.45■■■□□ 2.14
SOHLH1-201ENST00000298466 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.45■■■□□ 2.14
SOHLH1-201ENST00000298466 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.44■■■□□ 2.14
SOHLH1-201ENST00000298466 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.43■■■□□ 2.14
SOHLH1-201ENST00000298466 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.43■■■□□ 2.14
SOHLH1-201ENST00000298466 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
SOHLH1-201ENST00000298466 CASZ1Q86V15 1759 aa28.42■■■□□ 2.14
SOHLH1-201ENST00000298466 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.4■■■□□ 2.14
SOHLH1-201ENST00000298466 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.39■■■□□ 2.14
SOHLH1-201ENST00000298466 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
SOHLH1-201ENST00000298466 BICDL1Q6ZP65 573 aa28.39■■■□□ 2.14
SOHLH1-201ENST00000298466 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.39■■■□□ 2.14
SOHLH1-201ENST00000298466 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.39■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.39■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.39■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.38■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 MTFR1LQ9H019 292 aa28.38■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.37■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 F6X3S4 739 aa28.37■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 NLGN1Q8N2Q7 840 aa28.37■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.37■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 ADCY9O60503 1353 aa28.36■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.35■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 KSR2Q6VAB6 950 aa28.35■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 GPTP24298 496 aa28.35■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 NFIXQ14938 502 aa28.35■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.35■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 SCN7AQ01118 1682 aa28.34■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 MMP10P09238 476 aa28.33■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.33■■■□□ 2.13
SOHLH1-201ENST00000298466 BCORQ6W2J9 1755 aa28.32■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 CACNA1FO60840 1977 aa28.32■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.32■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 TM4SF1P30408 202 aa28.32■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 DDR1Q08345 913 aa28.31■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 TCIRG1Q13488 830 aa28.31■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 MYD88Q99836 296 aa28.31■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 PTGER2P43116 358 aa28.3■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 SETDB2Q96T68 719 aa28.3■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 PTPRCP08575 1304 aa28.3■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.3■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM177BA6PVY3 158 aa28.3■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.3■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.3■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 TNNQ9UQP3 1299 aa28.3■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 NUP98P52948 1817 aa28.29■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.29■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 SPON1Q9HCB6 807 aa28.29■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 KIF16BQ96L93 1317 aa28.28■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.28■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 RGL2O15211 777 aa28.28■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.27■■■□□ 2.12
SOHLH1-201ENST00000298466 IGKV5-2P06315 115 aa28.26■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 ATP10DQ9P241 1426 aa28.26■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.26■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 PLIN1O60240 522 aa28.25■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.25■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 PARP3Q9Y6F1 533 aa28.25■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 SERPINB2P05120 415 aa28.24■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 TRIM27P14373 513 aa28.24■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 POLD1P28340 1107 aa28.24■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 SUSD4Q5VX71 490 aa28.24■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 NLRP10Q86W26 655 aa28.24■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 CCDC24Q8N4L8 307 aa28.24■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.24■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.23■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.22■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.22■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 BEND3Q5T5X7 828 aa28.22■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.22■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.22■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.2■■■□□ 2.11
SOHLH1-201ENST00000298466 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.2■■■□□ 2.1
SOHLH1-201ENST00000298466 SYNE4Q8N205 404 aa28.2■■■□□ 2.1
SOHLH1-201ENST00000298466 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
SOHLH1-201ENST00000298466 LINS1Q8NG48 757 aa28.19■■■□□ 2.1
SOHLH1-201ENST00000298466 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
SOHLH1-201ENST00000298466 PARP10Q53GL7 1025 aa28.19■■■□□ 2.1
SOHLH1-201ENST00000298466 PRR5LQ6MZQ0 368 aa28.18■■■□□ 2.1
SOHLH1-201ENST00000298466 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.18■■■□□ 2.1
SOHLH1-201ENST00000298466 NPHP1O15259 732 aa28.17■■■□□ 2.1
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