RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216014.8

KDELR3-201, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-201ENST00000216014 TRIM27P14373 513 aa25.53■■□□□ 1.68
KDELR3-201ENST00000216014 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
KDELR3-201ENST00000216014 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.53■■□□□ 1.68
KDELR3-201ENST00000216014 ARXQ96QS3 562 aa25.53■■□□□ 1.68
KDELR3-201ENST00000216014 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.53■■□□□ 1.68
KDELR3-201ENST00000216014 RLBP1P12271 317 aa25.52■■□□□ 1.68
KDELR3-201ENST00000216014 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.52■■□□□ 1.68
KDELR3-201ENST00000216014 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.68
KDELR3-201ENST00000216014 STK32BQ9NY57 414 aa25.51■■□□□ 1.68
KDELR3-201ENST00000216014 KIF16BQ96L93 1317 aa25.51■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 SSFA2P28290 1259 aa25.51■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.51■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.51■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.51■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.5■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.5■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.5■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 PTPRCP08575 1304 aa25.49■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.49■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 KSR2Q6VAB6 950 aa25.49■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.49■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 CASZ1Q86V15 1759 aa25.48■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.48■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.48■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 PANK1Q8TE04 598 aa25.48■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 NARFQ9UHQ1 456 aa25.48■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.46■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 ABCC4O15439 1325 aa25.46■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 ADRA2BP18089 450 aa25.46■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 RFC4P35249 363 aa25.46■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.46■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.46■■□□□ 1.67
KDELR3-201ENST00000216014 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.45■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 A0A087WZG4 1122 aa25.44■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 IGKV5-2P06315 115 aa25.44■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 GYS1P13807 737 aa25.44■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 FKBP8Q14318 412 aa25.44■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.43■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 SOCS7O14512 581 aa25.43■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.43■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 MYD88Q99836 296 aa25.43■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.43■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 MSH5O43196 834 aa25.43■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 BEND3Q5T5X7 828 aa25.42■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.42■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.41■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 GPTP24298 496 aa25.41■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.41■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 ZPR1O75312 459 aa25.4■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 MSL1Q68DK7 614 aa25.4■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.4■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.4■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 TCIRG1Q13488 830 aa25.4■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
KDELR3-201ENST00000216014 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.39■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.38■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 ATP10DQ9P241 1426 aa25.38■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 COG6Q9Y2V7 657 aa25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.36■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 NFIXQ14938 502 aa25.36■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 DDR1Q08345 913 aa25.34■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.34■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 NLRP10Q86W26 655 aa25.34■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 LINS1Q8NG48 757 aa25.34■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 PDE3AQ14432 1141 aa25.34■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 SYNE4Q8N205 404 aa25.34■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 TM4SF1P30408 202 aa25.33■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 SUSD4Q5VX71 490 aa25.33■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 CRBNQ96SW2 442 aa25.33■■□□□ 1.65
KDELR3-201ENST00000216014 FAM177BA6PVY3 158 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-201ENST00000216014 ZBTB7AO95365 584 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-201ENST00000216014 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-201ENST00000216014 GCKRQ14397 625 aa25.31■■□□□ 1.64
KDELR3-201ENST00000216014 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.31■■□□□ 1.64
KDELR3-201ENST00000216014 RGL2O15211 777 aa25.3■■□□□ 1.64
KDELR3-201ENST00000216014 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
KDELR3-201ENST00000216014 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
KDELR3-201ENST00000216014 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
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