RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRX1	YOL077C	ATG13	Q06628	738 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BRX1	YOL077C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BRX1	YOL077C	APL1	P27351	700 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRX1	YOL077C	PBY1	P38254	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRX1	YOL077C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BRX1	YOL077C	TPO2	P53283	614 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRX1	YOL077C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BRX1	YOL077C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BRX1	YOL077C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BRX1	YOL077C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BRX1	YOL077C	ACE2	P21192	770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRX1	YOL077C	ELM1	P32801	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRX1	YOL077C	NIT1	P40447	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRX1	YOL077C	SPO75	Q07798	868 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRX1	YOL077C	CMP2	P14747	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	RNQ1	P25367	405 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	PPH3	P32345	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	YBR184W	P38299	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	SGD1	Q06132	899 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	IRC24	P40580	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	YJL049W	P47048	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	NNF1	P47149	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	OSW2	Q12202	724 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	RAD4	P14736	754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	SCT1	P32784	759 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	STE5	P32917	917 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	HFM1	P51979	1187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	CDA2	Q06703	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	MDM38	Q08179	573 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
BRX1	YOL077C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	GAL10	P04397	699 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
BRX1	YOL077C	TIM54	P47045	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	ERP6	P53198	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	ROT1	Q03691	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	ADE8	P04161	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	FUN30	P31380	1131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	YKL151C	P36059	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	LAM1	P38851	1228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	ALR2	P43553	858 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	MTC3	P53077	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	SRT1	Q03175	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	MSC2	Q03455	724 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	EAF1	Q06337	982 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	ENA1	P13587	1091 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	ARE1	P25628	610 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	CDC11	P32458	415 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	PFD1	P46988	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	RIM8	P53179	542 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	FMP25	Q08023	583 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	YRO2	P38079	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	YAP1801	P38856	637 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	CCC2	P38995	1004 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	MEF2	P39677	819 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	SPT20	P50875	604 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	YPL277C	Q08989	487 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRX1	YOL077C	SOD2	P00447	233 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	SRM1	P21827	482 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	GIC1	P38785	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	TAT2	P38967	592 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	UBP5	P39944	805 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	GCN5	Q03330	439 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	UBX5	Q06682	500 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	XYL2	Q07993	356 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	TOD6	P34219	525 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	SIT1	P39980	628 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	YER158C	P40095	573 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	HUL4	P40985	892 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	GYP7	P48365	746 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	PLB2	Q03674	706 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	RXT3	Q07458	294 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	RPC82	P32349	654 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	SRP101	P32916	621 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRX1	YOL077C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64

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