RNA–Protein interactions for RNA: YMR112C

MED11, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene MED11, Length 396 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MED11	YMR112C	DOM34	P33309	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	MEF1	P25039	761 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	PMT3	P47190	753 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	LCD1	Q04377	747 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	ATG13	Q06628	738 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	PPH3	P32345	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	SLA2	P33338	968 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	YBR284W	P38150	797 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	ALG2	P43636	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	ACM1	Q08981	209 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	NUP145	P49687	1317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	ADE8	P04161	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	AFR1	P33304	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	YEL1	P34225	687 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	HLJ1	P48353	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	NCE103	P53615	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	YNL193W	P53870	558 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MED11	YMR112C	RAD53	P22216	821 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	DSS1	P39112	969 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	YJL045W	P47052	634 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	YGR237C	P50089	785 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	TNA1	P53322	534 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	SNF5	P18480	905 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	PRO1	P32264	428 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	SPC29	P33419	253 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	YRO2	P38079	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	BAP2	P38084	609 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	GPB2	P39717	880 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	MGS1	P40151	587 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	TOK1	P40310	691 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	ALT1	P52893	592 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	COG8	Q04632	607 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	TDA6	Q06466	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	THI73	Q07904	523 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	VBA3	P25594	458 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	SFA1	P32771	386 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	YSC84	P32793	468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	EMC3	P36039	253 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	YKL151C	P36059	337 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	GPT2	P36148	743 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	RRM3	P38766	723 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	SKN7	P38889	622 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	MXR1	P40029	184 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	TPM2	P40414	161 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	YNR014W	P53719	212 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	UME1	Q03010	460 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	YOL057W	Q08225	711 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	COQ4	O13525	335 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	SRD1	P09007	221 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
MED11	YMR112C	NPP1	P25353	742 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	REC104	P33323	182 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	UGA2	P38067	497 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	GYP7	P48365	746 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	ATP25	Q03153	612 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	CDC9	P04819	755 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
MED11	YMR112C	MTC2	P34246	357 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	GRX7	P38068	203 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	PIK1	P39104	1066 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	GYP8	P43570	497 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	GPG1	P53130	126 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	DAM1	P53267	343 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	TPP1	Q03796	238 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	ENV7	Q12003	364 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	TMA17	Q12513	150 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MED11	YMR112C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64

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