RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	COQ4	O13525	335 aa		5.95	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	TOP3	P13099	656 aa		5.95	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	BAP2	P38084	609 aa		5.95	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	YHL012W	P38709	493 aa		5.95	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	HUL4	P40985	892 aa		5.95	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	CIT3	P43635	486 aa		5.95	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.95	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	YKL151C	P36059	337 aa		5.94	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	UGA2	P38067	497 aa		5.94	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	YBR284W	P38150	797 aa		5.94	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	YLR122C	Q12312	125 aa		5.94	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	PRO1	P32264	428 aa		5.93	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	COQ2	P32378	372 aa		5.93	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	ERT1	P38140	529 aa		5.93	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	TPO2	P53283	614 aa		5.93	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	YPL034W	Q03083	165 aa		5.93	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	PPH3	P32345	308 aa		5.92	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	AFR1	P33304	620 aa		5.92	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	PIK1	P39104	1066 aa		5.92	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	GEM1	P39722	662 aa		5.92	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	SIT1	P39980	628 aa		5.92	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	RCM1	P53972	490 aa		5.92	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	BI4	P03879	638 aa		5.91	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	THI4	P32318	326 aa		5.91	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	CCZ1	P38273	704 aa		5.91	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	PEX7	P39108	375 aa		5.91	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	NPP1	P25353	742 aa		5.9	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	CDC11	P32458	415 aa		5.9	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	MDL2	P33311	773 aa		5.9	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	MAL11	P53048	616 aa		5.9	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.9	□□□□□ -1.46	not detected
RPC17	YJL011C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	PET10	P36139	283 aa		5.89	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	MNN1	P39106	762 aa		5.89	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	RSC58	Q07979	502 aa		5.89	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	TRE1	Q08919	783 aa		5.89	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	YPR071W	Q12346	211 aa		5.89	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	CHS2	P14180	963 aa		5.88	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	YRO2	P38079	344 aa		5.88	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	NPP2	P39997	493 aa		5.88	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	MDM38	Q08179	573 aa		5.88	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	MSH2	P25847	964 aa		5.87	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	KAE1	P36132	386 aa		5.87	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	GIC1	P38785	314 aa		5.87	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	GDH3	P39708	457 aa		5.87	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	TOK1	P40310	691 aa		5.87	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	MTC3	P53077	123 aa		5.87	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	NTG2	Q08214	380 aa		5.87	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	PTC7	P38797	343 aa		5.86	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	GTS1	P40956	396 aa		5.86	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	YJR142W	P47173	342 aa		5.86	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	YGR130C	P53278	816 aa		5.86	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	LCD1	Q04377	747 aa		5.86	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	YLL058W	Q12198	575 aa		5.86	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	ADE8	P04161	214 aa		5.85	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	ACE2	P21192	770 aa		5.85	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	AIM26	P32858	118 aa		5.85	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	DOM34	P33309	386 aa		5.85	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	HFM1	P51979	1187 aa		5.85	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	ATG13	Q06628	738 aa		5.85	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	MEF1	P25039	761 aa		5.84	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	YER158C	P40095	573 aa		5.84	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	RRT14	P40470	206 aa		5.84	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	GYP7	P48365	746 aa		5.84	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	SDH1	Q00711	640 aa		5.84	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	SRT1	Q03175	343 aa		5.84	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	SSY1	Q03770	852 aa		5.84	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	RSB1	Q08417	382 aa		5.84	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	SVS1	Q12254	260 aa		5.84	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
RPC17	YJL011C	TRP3	P00937	484 aa		5.83	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	YKR073C	P36153	106 aa		5.83	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.83	□□□□□ -1.48	not detected
RPC17	YJL011C	XYL2	Q07993	356 aa		5.83	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	NSI1	Q12457	570 aa		5.83	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	CYC7	P00045	113 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	REC104	P33323	182 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
RPC17	YJL011C	ALG2	P43636	503 aa		5.82	□□□□□ -1.48

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