RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TNP2Q05952 138 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NR1H3Q13133 447 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD33P20138 364 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATP4AP20648 1035 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NACC1Q96RE7 527 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MDFIQ99750 246 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ELOA3Q8NG57 546 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM157BP0CG42 384 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLA2G4AP47712 749 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TLR1Q15399 786 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A1W2PNR3 127 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ALAS2P22557 587 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LAMC2Q13753 1193 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM117AQ9C073 453 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM229AH3BQW9 127 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MCTP1Q6DN14 999 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MARK1Q9P0L2 795 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C9orf172C9J069 976 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EFSO43281 561 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADGRE1Q14246 886 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 M0R082 166 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SIN3BO75182 1162 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GRIK4Q16099 956 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SYT9Q86SS6 491 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AIDAQ96BJ3 306 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STRN4Q9NRL3 753 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPR37L1O60883 481 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NID1P14543 1247 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 USP4Q13107 963 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MBTPS1Q14703 1052 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LCE1DQ5T752 114 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZIC5Q96T25 663 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SCNN1DP51172 638 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TNFRSF25Q93038 417 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ALBP02768 609 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 INHAP05111 366 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SELPP16109 830 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ELNP15502 786 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TXKP42681 527 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMTNP53814 917 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RNF112Q9ULX5 631 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SOCS7O14512 581 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PAX4O43316 350 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GDF10P55107 478 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms