RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456317.1

TTPAL-204, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 2

Gene TTPAL, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-204ENST00000456317 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 C7P10643 843 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 LHX8Q68G74 356 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 DEFB115Q30KQ5 88 aa11.29□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 TRAPPC3LQ5T215 181 aa11.29□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 POTECB2RU33 542 aa11.28□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 RGL2O15211 777 aa11.28□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.28□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 MCOLN1Q9GZU1 580 aa11.28□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 C4AP0C0L4 1744 aa11.28□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TTPAL-204ENST00000456317 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 TIAM2Q8IVF5 1701 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 CHRNA5P30532 468 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 SIK1P57059 783 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 IP6K1Q92551 441 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 EVC2Q86UK5 1308 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 POTEJP0CG39 1038 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 RFC4P35249 363 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 ATP6V1AP38606 617 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 PASKQ96RG2 1323 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 MEGF6O75095 1541 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 TATP17735 454 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 GRM1Q13255 1194 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 DGKZQ13574 1117 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 LDHDQ86WU2 507 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 GCC1Q96CN9 775 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 CGNL1Q0VF96 1302 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 RASSF10A6NK89 507 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 GYS1P13807 737 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 SOX10P56693 466 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 NME9Q86XW9 330 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 TSKSQ9UJT2 592 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 USP31Q70CQ4 1352 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 IQCA1LA6NCM1 817 aa11.22□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 AMPHP49418 695 aa11.22□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 ERFEQ4G0M1 354 aa11.22□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 PIGBQ92521 554 aa11.22□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 ITGB4P16144 1822 aa11.21□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 ECE1P42892 770 aa11.21□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 ITPK1Q13572 414 aa11.21□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 IER5LQ5T953 404 aa11.21□□□□□ -0.61
TTPAL-204ENST00000456317 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa11.2□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 NBPF1Q3BBV0 1214 aa11.2□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 USHBP1Q8N6Y0 703 aa11.2□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 RGPD2P0DJD1 1756 aa11.2□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 DDNO94850 711 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 SEC24BO95487 1268 aa11.19□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 TTLL6Q8N841 843 aa11.19□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 CAPNS2Q96L46 248 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 CA12O43570 354 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 HOXC9P31274 260 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 NBPF15Q8N660 670 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 CD163L1Q9NR16 1453 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 MON2Q7Z3U7 1717 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 NFKBIEO00221 500 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 GOLGA2Q08379 1002 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 NBPF6Q5VWK0 638 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 CYP4F22Q6NT55 531 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 NBPF4Q96M43 638 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 ASAP1Q9ULH1 1129 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 CYP27B1O15528 508 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 DDR1Q08345 913 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 CNTROBQ8N137 903 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-204ENST00000456317 DLL1O00548 723 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPAL-204ENST00000456317 RPS6KA4O75676 772 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPAL-204ENST00000456317 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTPAL-204ENST00000456317 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTPAL-204ENST00000456317 TMC1Q8TDI8 760 aa11.14□□□□□ -0.63
TTPAL-204ENST00000456317 OTUD5Q96G74 571 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.6 ms