RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306167.11

MTM1-201, Transcript of myotubularin 1, humanhuman

TSL 5

Gene MTM1, Length 2,955 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1-201ENST00000306167 LILRB3O75022 631 aa7.19□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 SOX10P56693 466 aa7.19□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 KCNA1Q09470 495 aa7.19□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 RRAGCQ9HB90 399 aa7.19□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.18□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.18□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 NBPF15Q8N660 670 aa7.18□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.18□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 NRAPQ86VF7 1730 aa7.17□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 SPTLC1O15269 473 aa7.17□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.17□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 SMAPO00193 183 aa7.17□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 CD46P15529 392 aa7.17□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 WWC1Q8IX03 1113 aa7.17□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 STK32AQ8WU08 396 aa7.17□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.17□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 NALCNQ8IZF0 1738 aa7.17□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.16□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.16□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 USTQ9Y2C2 406 aa7.16□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 MBD5Q9P267 1494 aa7.16□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 KRT28Q7Z3Y7 464 aa7.16□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.16□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.16□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.16□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.262e-6■□□□□ 8.5
MTM1-201ENST00000306167 EPAS1Q99814 870 aa7.15□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.15□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 ABCA3Q99758 1704 aa7.15□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 CCNB3Q8WWL7 1395 aa7.15□□□□□ -1.26
MTM1-201ENST00000306167 PLCG2P16885 1265 aa7.15□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 EVX2Q03828 476 aa7.15□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.15□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 STRN4Q9NRL3 753 aa7.15□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 CNTNAP1P78357 1384 aa7.14□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.14□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 ALG2Q9H553 416 aa7.14□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.14□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 KIF15Q9NS87 1388 aa7.14□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 C10orf71Q711Q0 1435 aa7.14□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 PIK3CDO00329 1044 aa7.14□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 VEGFBP49765 207 aa7.14□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.13□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.13□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.13□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 TSPY4P0CV99 314 aa7.13□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 TSPY10P0CW01 314 aa7.13□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.13□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 SNX27Q96L92 541 aa7.13□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 TECPR2O15040 1411 aa7.13□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 PSME1Q06323 249 aa7.12□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.12□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 DGKZQ13574 1117 aa7.12□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 ZNF827Q17R98 1081 aa7.12□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.12□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.12□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 TTC13Q8NBP0 860 aa7.12□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.12□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa7.12□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.12□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 CCDC144AA2RUR9 1427 aa7.12□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 PXDNLA1KZ92 1463 aa7.12□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.11□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.11□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 TSKSQ9UJT2 592 aa7.11□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 COL9A1P20849 921 aa7.11□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 SERPINB4P48594 390 aa7.11□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.11□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 RDH13Q8NBN7 331 aa7.11□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.11□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 TNS3Q68CZ2 1445 aa7.11□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 CCDC18Q5T9S5 1454 aa7.11□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.11□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.11□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 PRSS12P56730 875 aa7.11□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 KCPQ6ZWJ8 1503 aa7.11□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 CCDC141Q6ZP82 1450 aa7.1□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 FOSBP53539 338 aa7.1□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.1□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 ARHGEF10O15013 1369 aa7.1□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 CFAP99D6REC4 459 aa7.1□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 NUDT7P0C024 238 aa7.1□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 CACNA1GO43497 2377 aa7.1□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 METP08581 1390 aa7.09□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.09□□□□□ -1.27
MTM1-201ENST00000306167 EVA1CP58658 441 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms