RNA–Protein interactions for RNA: YOL076W

MDM20, Transcript of Non-catalytic subunit of the NatB N-terminal acetyltransferase, yeast

Gene MDM20, Length 2,391 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM20	YOL076W	TAF1	P46677	1066 aa		3	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	MNL2	Q12205	849 aa		3	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	SAM35	P14693	329 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	CMP2	P14747	604 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	PPX1	P38698	397 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	TAT2	P38967	592 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	ROT1	Q03691	256 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	FRT1	Q99332	602 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	SCT1	P32784	759 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	ENT3	P47160	408 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	YDL177C	Q12257	170 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	not detected
MDM20	YOL076W	CTS1	P29029	562 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	GPB2	P39717	880 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	HCM1	P25364	564 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	ALG3	P38179	458 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	YGL140C	P53120	1219 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	GPB1	Q08886	897 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	THI80	P35202	319 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	RGD1	P38339	666 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	MEF2	P39677	819 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	SVS1	Q12254	260 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	YPL109C	Q02981	657 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	STE11	P23561	717 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	PEP7	P32609	515 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	MCM7	P38132	845 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	MRL1	Q06815	381 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	AIM21	P40563	679 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	UBA2	P52488	636 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	ENA1	P13587	1091 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	MSE1	P48525	536 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	ENA2	Q01896	1091 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	GIS1	Q03833	894 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	ENA5	Q12691	1091 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	GAL10	P04397	699 aa		2.94	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	SEC8	P32855	1065 aa		2.94	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	TMA10	Q06177	86 aa		2.94	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	AIM39	Q08223	395 aa		2.94	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.94	□□□□□ -1.94	not detected
MDM20	YOL076W	HSL1	P34244	1518 aa		2.94	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	DOM34	P33309	386 aa		2.93	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	POA1	P38218	177 aa		2.93	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	GPI13	Q07830	1017 aa		2.93	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	DAK2	P43550	591 aa		2.93	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	CNN1	P43618	361 aa		2.93	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	STU2	P46675	888 aa		2.93	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.93	□□□□□ -1.94	not detected
MDM20	YOL076W	SIW14	P53965	281 aa		2.92	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	OSW2	Q12202	724 aa		2.92	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	YGR122W	P53272	402 aa		2.92	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	SGS1	P35187	1447 aa		2.91	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	BAS1	P22035	811 aa		2.91	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	ASF1	P32447	279 aa		2.91	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	UGA4	P32837	571 aa		2.91	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	ROD1	Q02805	837 aa		2.91	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	PUS9	Q12069	462 aa		2.91	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	MLS1	P30952	554 aa		2.9	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	RRT14	P40470	206 aa		2.9	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	YDR132C	Q03900	495 aa		2.9	□□□□□ -1.94
MDM20	YOL076W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	RDH54	P38086	958 aa		2.9	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	GEM1	P39722	662 aa		2.9	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	ZRG8	P40021	1076 aa		2.9	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	VPS30	Q02948	557 aa		2.9	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	SPO20	Q04359	397 aa		2.9	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	CDC20	P26309	610 aa		2.89	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	BAP2	P38084	609 aa		2.89	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	TIM44	Q01852	431 aa		2.89	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	ACM1	Q08981	209 aa		2.89	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	GNT1	Q12096	491 aa		2.89	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		2.89	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	CCC2	P38995	1004 aa		2.89	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	FAA3	P39002	694 aa		2.89	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	RAD2	P07276	1031 aa		2.88	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	YLR224W	Q05947	369 aa		2.88	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	SNF5	P18480	905 aa		2.88	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	EMC1	P25574	760 aa		2.88	□□□□□ -1.95
MDM20	YOL076W	MET4	P32389	672 aa		2.88	□□□□□ -1.95

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