RNA–Protein interactions for RNA: YOL053W

AIM39, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene AIM39, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM39	YOL053W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	RTA1	P53047	317 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	YGR045C	P53229	120 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	ERS1	P17261	260 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	HSE1	P38753	452 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	VPS53	P47061	822 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	YGL081W	P53156	320 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	GNT1	Q12096	491 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	MSH2	P25847	964 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	BET3	P36149	193 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	DNM1	P54861	757 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	CDC11	P32458	415 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	DSE4	P53753	1117 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.68	□□□□□ -1.5	not detected
AIM39	YOL053W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	YDL176W	Q12027	708 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	NHA1	Q99271	985 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	SRM1	P21827	482 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	NFS1	P25374	497 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	GRX4	P32642	244 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	SCT1	P32784	759 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	CCC2	P38995	1004 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	YPL260W	Q08977	551 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	TOM20	P35180	183 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	YDR306C	Q06640	478 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	NTG2	Q08214	380 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	YOR223W	Q12015	292 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	YER152C	P10356	443 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	KIP1	P28742	1111 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	PNT1	P38969	423 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	UBP12	P39538	1254 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	GDH3	P39708	457 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.65	□□□□□ -1.5	not detected
AIM39	YOL053W	JJJ3	P47138	172 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	TPO2	P53283	614 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	UGO1	Q03327	502 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	SPO21	Q12411	609 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AIM39	YOL053W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	YBR284W	P38150	797 aa		5.64	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	GEM1	P39722	662 aa		5.64	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	TOP3	P13099	656 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	SFP1	P32432	683 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	DOM34	P33309	386 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	PEX6	P33760	1030 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	NNK1	P36003	928 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	MAL11	P53048	616 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	GIC2	Q06648	383 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	DPH6	Q12429	685 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	ADR1	P07248	1323 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	RRM3	P38766	723 aa		5.62	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	SIT1	P39980	628 aa		5.62	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	ADE8	P04161	214 aa		5.61	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	PPH3	P32345	308 aa		5.61	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	PET10	P36139	283 aa		5.61	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	GPB2	P39717	880 aa		5.61	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	YEN1	P40028	759 aa		5.61	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	MXR1	P40029	184 aa		5.61	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	NCE103	P53615	221 aa		5.61	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	TFB2	Q02939	513 aa		5.61	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	YPR071W	Q12346	211 aa		5.61	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	GPT2	P36148	743 aa		5.6	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	HPF1	Q05164	967 aa		5.6	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	MDM12	Q92328	271 aa		5.59	□□□□□ -1.51
AIM39	YOL053W	YRO2	P38079	344 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AIM39	YOL053W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
AIM39	YOL053W	YJL045W	P47052	634 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AIM39	YOL053W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52

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