RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	SPH1	Q06160	661 aa		12.17	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	OXR1	Q08952	273 aa		12.17	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	SMC6	Q12749	1114 aa		12.17	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	GSY1	P23337	708 aa		12.16	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	NDT80	P38830	627 aa		12.16	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	GAA1	P39012	614 aa		12.16	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	ROG3	P43602	733 aa		12.16	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	YAF9	P53930	226 aa		12.16	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	ARP6	Q12509	438 aa		12.16	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	MCD4	P36051	919 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	BSD2	P38356	321 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	GPB2	P39717	880 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	YGR273C	P53329	174 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	CBK1	P53894	756 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	ORC4	P54791	529 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	PSR2	Q07949	397 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	FYV10	P40492	516 aa		12.14	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	SSL2	Q00578	843 aa		12.14	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.13	□□□□□ -0.47	not detected
DDR2	YOL052C-A	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	PET10	P36139	283 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	BCD1	P38772	366 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	FUS2	Q05670	677 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	ADY4	Q05955	493 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	YLH47	Q06493	454 aa		12.13	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	HVG1	P0CE11	249 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	NUP82	P40368	713 aa		12.12	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	RBA50	Q04418	439 aa		12.11	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		12.1	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	YLR464W	P0CX17	216 aa		12.1	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	MIP1	P15801	1254 aa		12.1	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	PKC1	P24583	1151 aa		12.1	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	YEL076C	P39971	216 aa		12.1	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	WAR1	Q03631	944 aa		12.1	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	PHM6	Q05637	104 aa		12.1	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	AFT2	Q08957	416 aa		12.1	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	MCM2	P29469	868 aa		12.09	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	UTR4	P32626	227 aa		12.09	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	YGR125W	P53273	1036 aa		12.09	□□□□□ -0.47
DDR2	YOL052C-A	YGR237C	P50089	785 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	SEC5	P89102	971 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	CST9	Q06032	482 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	TLG2	Q08144	397 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	CLB5	P30283	435 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	PSY4	P38193	441 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	ERG7	P38604	731 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	PGA2	P53903	129 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	JIP4	Q03361	876 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	RKM4	Q12504	494 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	CLN3	P13365	580 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	ESS1	P22696	170 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	RAM2	P29703	316 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	EUG1	P32474	517 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	SEC8	P32855	1065 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	UBP11	P36026	717 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	SAP190	P36123	1033 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	SIP3	P38717	1229 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	RSC30	P38781	883 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	HUL5	P53119	910 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	TY3A-G	Q12173	290 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	TY3A-I	Q99219	290 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	SUV3	P32580	737 aa		12.05	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	IXR1	P33417	597 aa		12.05	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	SHP1	P34223	423 aa		12.05	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	VPS29	P38759	282 aa		12.05	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	SPR3	P41901	512 aa		12.05	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	BRE2	P43132	505 aa		12.05	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	GUP1	P53154	560 aa		12.05	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	SRD1	P09007	221 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	MRC1	P25588	1096 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	PIH1	P38768	344 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	DIP5	P53388	608 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDR2	YOL052C-A	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48

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