RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	ALT1	P52893	592 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	SHE9	Q04172	456 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	YPL260W	Q08977	551 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	RAD4	P14736	754 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	KIP1	P28742	1111 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	SKN7	P38889	622 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	IOC3	P43596	787 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	YGL176C	P46945	554 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	TPP1	Q03796	238 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	NSE3	Q05541	303 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	SPO21	Q12411	609 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.91	□□□□□ -1.46	not detected
MTD1	YKR080W	MRP8	P35719	219 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	VBA5	P36172	582 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	GNT1	Q12096	491 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	YPL066W	Q12194	479 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	AIM44	Q99299	758 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.9	□□□□□ -1.46	not detected
MTD1	YKR080W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	COQ2	P32378	372 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	YBR184W	P38299	523 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	GPB2	P39717	880 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	TIM54	P47045	478 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	YJL045W	P47052	634 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.9	□□□□□ -1.46	not detected
MTD1	YKR080W	MCA1	Q08601	432 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
MTD1	YKR080W	SAF1	P38352	637 aa		5.89	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	IRR1	P40541	1150 aa		5.89	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	MMM1	P41800	426 aa		5.89	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	EAR1	Q03212	550 aa		5.89	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	BDF2	Q07442	638 aa		5.89	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	SSN2	P38931	1420 aa		5.89	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	YER152C	P10356	443 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	STE5	P32917	917 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	HUL5	P53119	910 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	YPL034W	Q03083	165 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	PBY1	P38254	753 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	CIT3	P43635	486 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	SPO75	Q07798	868 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	YOR131C	Q12486	218 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	OSH2	Q12451	1283 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	ESP1	Q03018	1630 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	TAF2	P23255	1407 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	CHS2	P14180	963 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	YSC84	P32793	468 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	MBP1	P39678	833 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	TNA1	P53322	534 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	RPN4	Q03465	531 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	FMP25	Q08023	583 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	COQ4	O13525	335 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	PNT1	P38969	423 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	ERP6	P53198	216 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	RCM1	P53972	490 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	YLR122C	Q12312	125 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	YVC1	Q12324	675 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
MTD1	YKR080W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	KAE1	P36132	386 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	YHL012W	P38709	493 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	MXR1	P40029	184 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	PFD1	P46988	109 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	YGR125W	P53273	1036 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	EAF1	Q06337	982 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	FLC1	Q08967	793 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.82	□□□□□ -1.48	not detected
MTD1	YKR080W	NSI1	Q12457	570 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	SAM35	P14693	329 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	SNF5	P18480	905 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	ARE1	P25628	610 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	MDL2	P33311	773 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	BAP2	P38084	609 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	CCZ1	P38273	704 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	ALR2	P43553	858 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MTD1	YKR080W	OSW7	P43611	510 aa		5.81	□□□□□ -1.48

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 63.1 ms