RNA–Protein interactions for RNA: YJL192C

SOP4, Transcript of ER-membrane protein, yeast

Gene SOP4, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOP4	YJL192C	PRO1	P32264	428 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	YPL109C	Q02981	657 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	TRE1	Q08919	783 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	OXR1	Q08952	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	DFG16	Q99234	619 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
SOP4	YJL192C	PTC7	P38797	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	PEX7	P39108	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	YML020W	Q03722	664 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	VPS15	P22219	1454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	ADP1	P25371	1049 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	IME2	P32581	645 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	ELM1	P32801	640 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	PIC2	P40035	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	GTS1	P40956	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	YGL140C	P53120	1219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	ADI1	Q03677	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	AOS1	Q06624	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	MHP1	P43638	1398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	RDH54	P38086	958 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	YJL045W	P47052	634 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	TCB2	P48231	1178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	ATG14	P38270	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	SNT2	P53127	1403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	YHL012W	P38709	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	GDB1	Q06625	1536 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	VTH1	P40438	1549 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	VTH2	P40890	1549 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	CAT8	P39113	1433 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	SAM35	P14693	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	ATE1	P16639	503 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	CLC1	P17891	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	MCM2	P29469	868 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	AFG2	P32794	780 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	OPY1	P38271	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	HSE1	P38753	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	ECL1	P48235	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	LAP2	Q10740	671 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	ADD66	P36040	267 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	GPB2	P39717	880 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	POL32	P47110	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	YGR122W	P53272	402 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	EST2	Q06163	884 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	FYV10	P40492	516 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	SPR28	Q04921	423 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	HDA2	Q06629	674 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	CDA2	Q06703	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	PDR12	Q02785	1511 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	MDS3	P53094	1487 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	IQG1	Q12280	1495 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	RAD2	P07276	1031 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	CYC8	P14922	966 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	AIM26	P32858	118 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	ALG3	P38179	458 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	YIR014W	P40570	242 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	ORC3	P54790	616 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	ROD1	Q02805	837 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	RKM2	Q03942	479 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	KIP1	P28742	1111 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	SLD2	P34252	453 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	NIT1	P40447	199 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	MRPS18	P42847	217 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SOP4	YJL192C	MCD1	Q12158	566 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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