RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	YNL193W	P53870	558 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	VPS72	Q03388	795 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	OPT2	Q06593	877 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	THI73	Q07904	523 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	SOG2	Q08817	791 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	LAP2	Q10740	671 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	PTC5	Q12511	572 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.37	□□□□□ -1.87	not detected
YMR31	YFR049W	DIT1	P21623	536 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	RAD53	P22216	821 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	GSY1	P23337	708 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	VBA3	P25594	458 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	SEC6	P32844	805 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	SWE1	P32944	819 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	MSC7	P38694	644 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	YJR120W	P47157	116 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	MAL11	P53048	616 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	GUP1	P53154	560 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	SCW11	P53189	542 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	UME1	Q03010	460 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	YMR074C	Q04773	145 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	AVO1	Q08236	1176 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	YIG1	Q08956	461 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	MEF1	P25039	761 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	AFG2	P32794	780 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	RGD1	P38339	666 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	PAF1	P38351	445 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	YAR028W	P39548	234 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	MPH1	P40562	993 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	DAS1	P47005	663 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	MEC3	Q02574	474 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	SPO71	Q03868	1245 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	RKM2	Q03942	479 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	GNT1	Q12096	491 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	NYV1	Q12255	253 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	ADE8	P04161	214 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	KAR1	P11927	433 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	SCT1	P32784	759 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	YRO2	P38079	344 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	HSE1	P38753	452 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	LEM3	P42838	414 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.35	□□□□□ -1.87	not detected
YMR31	YFR049W	PEX8	P53248	589 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	SLX4	Q12098	748 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	MDM12	Q92328	271 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	RAD18	P10862	487 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	PET10	P36139	283 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	BAP2	P38084	609 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	GIP2	P40036	548 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	ALG2	P43636	503 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.34	□□□□□ -1.87	not detected
YMR31	YFR049W	VPS53	P47061	822 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	GCV1	P48015	400 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	CUZ1	P53899	274 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	SND1	Q04007	877 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	YLL054C	Q12244	843 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	CDC9	P04819	755 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	YER152C	P10356	443 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	TED1	P40533	473 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	YGR045C	P53229	120 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	GCR2	Q01722	534 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	HFD1	Q04458	532 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	SPO21	Q12411	609 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	SAC7	P17121	654 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	KIP1	P28742	1111 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	CEM1	P39525	442 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	GPB2	P39717	880 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YMR31	YFR049W	MXR1	P40029	184 aa		3.32	□□□□□ -1.88

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