RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TXNRD1Q16881 649 aa17.06■□□□□ 0.32
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 LGR6Q9HBX8 967 aa17.06■□□□□ 0.32
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC27A3Q5K4L6 730 aa17.05■□□□□ 0.32
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PROM2Q8N271 834 aa17.05■□□□□ 0.32
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 QSER1Q2KHR3 1735 aa17.04■□□□□ 0.32
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC146Q8IYE0 955 aa17.03■□□□□ 0.32
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IL17REQ8NFR9 667 aa17.03■□□□□ 0.32
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TEFQ10587 303 aa17.02■□□□□ 0.32
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATG3Q9NT62 314 aa17.02■□□□□ 0.32
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 C4BP0C0L5 1744 aa17.01■□□□□ 0.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TJP1Q07157 1748 aa17.01■□□□□ 0.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KDM3BQ7LBC6 1761 aa17■□□□□ 0.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 RIPK4P57078 832 aa16.99■□□□□ 0.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.99■□□□□ 0.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa16.98■□□□□ 0.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCER2I3L3R5 266 aa16.98■□□□□ 0.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SIK1P57059 783 aa16.98■□□□□ 0.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DCTN1Q14203 1278 aa16.97■□□□□ 0.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CASZ1Q86V15 1759 aa16.97■□□□□ 0.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UBR3Q6ZT12 1888 aa16.97■□□□□ 0.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 STK32BQ9NY57 414 aa16.96■□□□□ 0.31
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 KCNQ4P56696 695 aa16.95■□□□□ 0.3
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TTC5Q8N0Z6 440 aa16.95■□□□□ 0.3
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC39A6Q13433 755 aa16.94■□□□□ 0.3
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF827Q17R98 1081 aa16.93■□□□□ 0.3
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC27Q2M243 656 aa16.88■□□□□ 0.29
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 C4AP0C0L4 1744 aa16.87■□□□□ 0.29
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KCNQ3O43525 872 aa16.87■□□□□ 0.29
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COL24A1Q17RW2 1714 aa16.87■□□□□ 0.29
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa16.86■□□□□ 0.29
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 FLAD1Q8NFF5 587 aa16.85■□□□□ 0.29
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16.85■□□□□ 0.29
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SSFA2P28290 1259 aa16.84■□□□□ 0.29
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CRKLP46109 303 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CHL1O00533 1208 aa16.83■□□□□ 0.28
SRP54-AS1-202ENST00000555015 STARD3NLO95772 234 aa16.83■□□□□ 0.28
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CFAP44Q96MT7 982 aa16.83■□□□□ 0.28
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IFT57Q9NWB7 429 aa16.83■□□□□ 0.28
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
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