RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525778.5

SOGA3-203, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 4,077 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-203ENST00000525778 GRIN2AQ12879 1464 aa21.42■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 BRD1O95696 1058 aa21.42■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 MLECQ14165 292 aa21.42■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.42■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 UBXN4Q92575 508 aa21.42■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 SPG7Q9UQ90 795 aa21.42■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 DTNBO60941 627 aa21.41■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 NSD2O96028 1365 aa21.41■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.41■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 CEP85Q6P2H3 762 aa21.4■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 NOS1P29475 1434 aa21.4■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 PLCD3Q8N3E9 789 aa21.4■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.4■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 ANAPC15P60006 121 aa21.4■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.4■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 F13A1P00488 732 aa21.39■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.39■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 LUZP1Q86V48 1076 aa21.39■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 KIF2CQ99661 725 aa21.39■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
SOGA3-203ENST00000525778 IFT140Q96RY7 1462 aa21.39■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.39■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 SRGAP3O43295 1099 aa21.38■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.38■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 SMTNL1A8MU46 457 aa21.38■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.38■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 FSD1Q9BTV5 496 aa21.38■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 KRT24Q2M2I5 525 aa21.37■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 SYT1P21579 422 aa21.37■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.37■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 DACT1Q9NYF0 836 aa21.37■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 ME1P48163 572 aa21.36■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.36■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 NECAB1Q8N987 351 aa21.36■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 TYRO3Q06418 890 aa21.36■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.36■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 DDX11Q96FC9 970 aa21.35■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 KIAA0556O60303 1618 aa21.35■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.35■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 PDILTQ8N807 584 aa21.35■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.35■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 SKILP12757 684 aa21.34■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.34■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 RAB11FIP3O75154 756 aa21.34■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 DISP1Q96F81 1524 aa21.34■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 ATP2B3Q16720 1220 aa21.33■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.33■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.33■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.33■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 SKIDA1Q1XH10 827 aa21.33■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 AK7Q96M32 723 aa21.33■■□□□ 1.01
SOGA3-203ENST00000525778 HSP90B2PQ58FF3 399 aa21.33■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 CHMLP26374 656 aa21.32■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 AK2P54819 239 aa21.32■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.32■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 CLEC17AQ6ZS10 378 aa21.32■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 DDIT3P35638 169 aa21.32■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.32■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 URI1O94763 535 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 ANKRD1Q15327 319 aa21.31■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 CFAP45Q9UL16 551 aa21.31■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.31■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 PTPRCP08575 1304 aa21.31■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 CPA1P15085 419 aa21.31■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 NME9Q86XW9 330 aa21.31■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.31■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 PTPRTO14522 1441 aa21.3■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.3■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 PALD1Q9ULE6 856 aa21.3■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 NEMFO60524 1076 aa21.3■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.3■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 CEP170Q5SW79 1584 aa21.3■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.29■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.29■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 LRMPQ12912 555 aa21.29■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.29■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.29■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 PLA2R1Q13018 1463 aa21.29■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.28■■□□□ 1
SOGA3-203ENST00000525778 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms