RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455235.5

ZDHHC3-208, Transcript of zinc finger DHHC-type containing 3, human

TSL 4

Gene ZDHHC3, Length 537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ZDHHC3-208	ENST00000455235	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
ZDHHC3-208	ENST00000455235	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SIK1	P57059	783 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
ZDHHC3-208	ENST00000455235	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ZDHHC3-208	ENST00000455235	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ZDHHC3-208	ENST00000455235	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ZDHHC3-208	ENST00000455235	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
ZDHHC3-208	ENST00000455235	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		32.26	■■■□□ 2.75
ZDHHC3-208	ENST00000455235	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		32.25	■■■□□ 2.75
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.25	■■■□□ 2.75
ZDHHC3-208	ENST00000455235	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		32.25	■■■□□ 2.75
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		32.25	■■■□□ 2.75
ZDHHC3-208	ENST00000455235	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		32.24	■■■□□ 2.75
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ITPK1	Q13572	414 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TJP1	Q07157	1748 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ZDHHC3-208	ENST00000455235	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		32.22	■■■□□ 2.75
ZDHHC3-208	ENST00000455235	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.22	■■■□□ 2.75
ZDHHC3-208	ENST00000455235	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		32.21	■■■□□ 2.75
ZDHHC3-208	ENST00000455235	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.2	■■■□□ 2.75
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SPON1	Q9HCB6	807 aa		32.2	■■■□□ 2.75
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		32.2	■■■□□ 2.75
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.19	■■■□□ 2.74
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MTFR1L	Q9H019	292 aa		32.17	■■■□□ 2.74
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ZBTB7A	O95365	584 aa		32.16	■■■□□ 2.74
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		32.15	■■■□□ 2.74
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
ZDHHC3-208	ENST00000455235	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PTGER2	P43116	358 aa		32.13	■■■□□ 2.73
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		32.13	■■■□□ 2.73
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TEF	Q10587	303 aa		32.12	■■■□□ 2.73
ZDHHC3-208	ENST00000455235	AK7	Q96M32	723 aa		32.12	■■■□□ 2.73
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ZDHHC3-208	ENST00000455235	NEFM	P07197	916 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ZDHHC3-208	ENST00000455235	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ZDHHC3-208	ENST00000455235	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
ZDHHC3-208	ENST00000455235	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SLC39A6	Q13433	755 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ZDHHC3-208	ENST00000455235	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		32.08	■■■□□ 2.73
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SSFA2	P28290	1259 aa		32.08	■■■□□ 2.73
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MCM10	Q7L590	875 aa		32.06	■■■□□ 2.72
ZDHHC3-208	ENST00000455235	GNPAT	O15228	680 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ZDHHC3-208	ENST00000455235	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	32.04	■■■□□ 2.72
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ZNF790	Q6PG37	636 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ZDHHC3-208	ENST00000455235	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
ZDHHC3-208	ENST00000455235	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.03	■■■□□ 2.72
ZDHHC3-208	ENST00000455235	C4A	P0C0L4	1744 aa		32.03	■■■□□ 2.72
ZDHHC3-208	ENST00000455235	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.02	■■■□□ 2.72
ZDHHC3-208	ENST00000455235	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		32.01	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		32.01	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		32	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		32	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SMIM5	Q71RC9	77 aa		31.99	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	BTBD11	A6QL63	1104 aa		31.98	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ANP32C	O43423	234 aa		31.98	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RPS6KA4	O75676	772 aa		31.98	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PHF14	O94880	888 aa		31.98	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ADRA2B	P18089	450 aa		31.97	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RUNDC1	Q96C34	613 aa		31.97	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MSH5	O43196	834 aa		31.96	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CCDC184	Q52MB2	194 aa		31.96	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
ZDHHC3-208	ENST00000455235	KCNQ3	O43525	872 aa		31.94	■■■□□ 2.7
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		31.94	■■■□□ 2.7
ZDHHC3-208	ENST00000455235	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		31.94	■■■□□ 2.7
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		31.93	■■■□□ 2.7
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RIPK4	P57078	832 aa		31.92	■■■□□ 2.7
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ARX	Q96QS3	562 aa		31.92	■■■□□ 2.7
ZDHHC3-208	ENST00000455235	POLD1	P28340	1107 aa		31.91	■■■□□ 2.7
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		31.91	■■■□□ 2.7
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MSL1	Q68DK7	614 aa		31.9	■■■□□ 2.7
ZDHHC3-208	ENST00000455235	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
ZDHHC3-208	ENST00000455235	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		31.89	■■■□□ 2.7
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
ZDHHC3-208	ENST00000455235	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		31.89	■■■□□ 2.69

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