RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-204ENST00000403904 PTF1AQ7RTS3 328 aa43.51■■■■■ 4.56
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CSNK1E-204ENST00000403904 MIS18AQ9NYP9 233 aa43.47■■■■■ 4.55
CSNK1E-204ENST00000403904 BTBD11A6QL63 1104 aa43.44■■■■■ 4.54
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CSNK1E-204ENST00000403904 CDCA7LQ96GN5 454 aa43.38■■■■■ 4.54
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CSNK1E-204ENST00000403904 ASAP1Q9ULH1 1129 aa43.38■■■■■ 4.54
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CSNK1E-204ENST00000403904 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
CSNK1E-204ENST00000403904 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP43.23■■■■■ 4.51
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CSNK1E-204ENST00000403904 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa43.14■■■■■ 4.5
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CSNK1E-204ENST00000403904 KCNQ4P56696 695 aa43.09■■■■■ 4.49
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CSNK1E-204ENST00000403904 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.48
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CSNK1E-204ENST00000403904 HOXB7P09629 217 aa42.96■■■■■ 4.47
CSNK1E-204ENST00000403904 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP42.96■■■■■ 4.47
CSNK1E-204ENST00000403904 TAF1LQ8IZX4 1826 aa42.96■■■■■ 4.47
CSNK1E-204ENST00000403904 LAMB4A4D0S4 1761 aa42.95■■■■■ 4.47
CSNK1E-204ENST00000403904 VAMP4O75379 141 aa42.95■■■■■ 4.47
CSNK1E-204ENST00000403904 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
CSNK1E-204ENST00000403904 NECTIN2Q92692 538 aa42.95■■■■■ 4.47
CSNK1E-204ENST00000403904 LINC00116Q8NCU8 138 aa42.94■■■■■ 4.46
CSNK1E-204ENST00000403904 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
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