RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 NFAT5O94916 1531 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 ANXA1P04083 346 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 CEP85Q6P2H3 762 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 RTL1A6NKG5 1358 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP3K5Q99683 1374 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 MEIS3Q99687 375 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC22Q5TAA0 569 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 MST1RQ04912 1400 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 FSD2A1L4K1 749 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAK2O60296 914 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 PXDNQ92626 1479 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 BRINP3Q76B58 766 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 TEFQ10587 303 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 STK31Q9BXU1 1019 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 ERBB3P21860 1342 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 FLIIQ13045 1269 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC37A3O60309 1634 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 BTBD11A6QL63 1104 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC39A6Q13433 755 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 USP26Q9BXU7 913 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 SDSP20132 328 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 HMMRO75330 724 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 RABEP1Q15276 862 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 RGPD5Q99666 1765 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 USP54Q70EL1 1684 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 GBP4Q96PP9 640 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 SLAIN2Q9P270 581 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 CACNA1FO60840 1977 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 PROSER3Q2NL68 480 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 CASC1Q6TDU7 716 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 SLIT3O75094 1523 aa23.06■■□□□ 1.28
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SH3BP1-201ENST00000357436 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 MRE11P49959 708 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 STRN4Q9NRL3 753 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 CLEC17AQ6ZS10 378 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 PTMSP20962 102 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 PDE1AP54750 535 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 PANK2Q9BZ23 570 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 ARXQ96QS3 562 aa23.03■■□□□ 1.28
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