RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172142.7

Nisch-222, Transcript of Nischarin, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 2,780 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-222ENSMUST00000172142 Q3TQI7 289 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
Nisch-222ENSMUST00000172142 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gse1Q3U3C9 1213 aa27.76■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kdm4aQ8BW72 1064 aa27.75■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Astn2Q80Z10 1352 aa27.74■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fam83gQ5SWY7 812 aa27.74■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Erbb4Q61527 1308 aa27.73■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Zscan25B2RX31 543 aa27.72■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 EvcP57680 1005 aa27.72■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Anapc15P60007 132 aa27.72■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pank2Q3U4S0 443 aa27.72■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ripk4Q9ERK0 786 aa27.72■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Topaz1E5FYH1 1653 aa27.72■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dip2aQ8BWT5 1523 aa27.72■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cpa2Q504N0 417 aa27.71■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 KinQ8K339 391 aa27.71■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mmp8O70138 465 aa27.71■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa27.7■■■□□ 2.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cwc27Q3TKY6 469 aa27.7■■■□□ 2.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tshz3Q8CGV9 1081 aa27.7■■■□□ 2.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Atp8b2P98199 1209 aa27.69■■■□□ 2.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mum1Q6DID5 682 aa27.69■■■□□ 2.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa27.69■■■□□ 2.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Snap23O09044 210 aa27.69■■■□□ 2.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Jakmip1Q8BVL9 626 aa27.68■■■□□ 2.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Chrna2Q91X60 512 aa27.68■■■□□ 2.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gzf1Q4VBD9 706 aa27.67■■■□□ 2.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mknk2Q8CDB0 459 aa27.67■■■□□ 2.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Casc1Q6TDU8 730 aa27.65■■■□□ 2.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mcmdc2E9Q956 681 aa27.64■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Strn4P58404 760 aa27.62■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccne1Q61457 408 aa27.62■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Chd1lQ9CXF7 900 aa27.62■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 PzpQ61838 1495 aa27.62■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nol12Q8BG17 217 aa27.62■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Stk36Q69ZM6 1316 aa27.61■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Hoxa7P02830 229 aa27.61■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Igsf1Q7TQA1 1317 aa27.61■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa27.61■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Olfml1Q8BSH2 233 aa27.61■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa27.61■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mindy4Q3UQI9 744 aa27.6■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pnma3Q8JZW8 466 aa27.6■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc173A0JLY1 547 aa27.6■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cabp4Q8VHC5 271 aa27.6■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Eya1P97767 591 aa27.59■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Znf335A2A5K6 1337 aa27.59■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa27.59■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cps1Q8C196 1500 aa27.59■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Sirt1Q923E4 737 aa27.58■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa27.58■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tnnt1O88346 262 aa27.58■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 IbspQ61711 324 aa27.58■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc7Q9D541 371 aa27.57■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Slit3Q9WVB4 1523 aa27.57■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 CemipQ8BI06 1361 aa27.57■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Med1Q925J9 1575 aa27.57■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Q3UJC8 639 aa27.57■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 E4f1Q8CCE9 783 aa27.57■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Anp32cQ64G17 123 aa27.56■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 FancaQ9JL70 1439 aa27.56■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 NcapgE9PWG6 1004 aa27.55■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dennd6aQ8BH65 605 aa27.55■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pcmtd1P59913 357 aa27.55■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fam184aE9PW83 1143 aa27.54■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Sox12Q04890 314 aa27.54■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Parp14Q2EMV9 1817 aa27.53■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Disp3A3KFU9 1347 aa27.53■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Chpf2Q3UU43 768 aa27.53■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Irx6Q9ER75 438 aa27.53■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa27.52■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Unc5clQ6R653 518 aa27.52■■■□□ 2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ms4a2P20490 235 aa27.51■■□□□ 1.99
Nisch-222ENSMUST00000172142 Irf5P56477 497 aa27.51■■□□□ 1.99
Nisch-222ENSMUST00000172142 Stk3Q9JI10 497 aa27.51■■□□□ 1.99
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tet3Q8BG87 1668 aa27.51■■□□□ 1.99
Nisch-222ENSMUST00000172142 HypkQ9CR41 129 aa27.51■■□□□ 1.99
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gjb2Q00977 226 aa27.5■■□□□ 1.99
Nisch-222ENSMUST00000172142 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa27.5■■□□□ 1.99
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pof1bQ8K4L4 587 aa27.5■■□□□ 1.99
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mlh1Q9JK91 760 aa27.5■■□□□ 1.99
Nisch-222ENSMUST00000172142 Atf5O70191 283 aa27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 105.3 ms