Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.156e-16■■■■■ 65.8
RPS3P23396 DOCK5-205ENST00000467709 4844 ntTSL 57.06□□□□□ -1.286e-16■■■■■ 65.8
RPS3P23396 MRPS28-209ENST00000522987 487 ntTSL 314.69□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 65.8
RPS3P23396 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 65.8
RPS3P23396 MRPS28-202ENST00000518271 487 ntTSL 511.84□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 65.8
RPS3P23396 MRPS28-208ENST00000521605 437 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 65.8
RPS3P23396 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.352e-9■■■■■ 65.8
RPS3P23396 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.511e-8■■■■■ 65.8
RPS3P23396 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.621e-8■■■■■ 65.8
RPS3P23396 THYN1-201ENST00000341541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.671e-8■■■■■ 65.8
RPS3P23396 THYN1-204ENST00000392595 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.671e-8■■■■■ 65.8
RPS3P23396 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.742e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.28e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.028e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 FBP1-202ENST00000414122 629 ntTSL 512.76□□□□□ -0.378e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-202ENST00000429243 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.378e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PAPSS1-208ENST00000514815 296 ntTSL 512.67□□□□□ -0.388e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 COPB1-209ENST00000533096 547 ntTSL 412.26□□□□□ -0.451e-18■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.68e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-208ENST00000549740 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.658e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 DYNLRB1-204ENST00000480759 1053 ntTSL 310.36□□□□□ -0.752e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-213ENST00000552846 407 ntTSL 310.28□□□□□ -0.768e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-201ENST00000379786 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.848e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-210ENST00000551003 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.948e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 CTH-203ENST00000411986 2044 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.068e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 CTH-201ENST00000346806 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.148e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-207ENST00000549581 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.148e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.158e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-205ENST00000549068 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.158e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.172e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.228e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.268e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-212ENST00000551945 261 ntAPPRIS ALT2 TSL 36.26□□□□□ -1.418e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.94□□□□□ -1.788e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRDX4-204ENST00000439422 554 ntTSL 31.35□□□□□ -2.198e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.184e-12■■■■■ 65.3
RPS3P23396 TSPAN7-208ENST00000494037 575 ntTSL 48□□□□□ -1.134e-12■■■■■ 65.3
RPS3P23396 TSPAN7-206ENST00000480976 553 ntTSL 45.91□□□□□ -1.464e-12■■■■■ 65.3
RPS3P23396 ESD-203ENST00000412582 921 ntTSL 34.29□□□□□ -1.724e-12■■■■■ 65.3
RPS3P23396 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.874e-12■■■■■ 65.3
RPS3P23396 ESD-204ENST00000471867 2410 ntTSL 21.91□□□□□ -2.14e-12■■■■■ 65.3
RPS3P23396 ESD-205ENST00000495654 701 ntTSL 51.28□□□□□ -2.24e-12■■■■■ 65.3
RPS3P23396 PSMB3-207ENST00000610434 510 ntTSL 310.39□□□□□ -0.752e-9■■■■■ 65
RPS3P23396 NDUFA4-203ENST00000470761 502 ntTSL 414.11□□□□□ -0.154e-9■■■■■ 64.8
RPS3P23396 SLC25A3-205ENST00000547444 517 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.19e-21■■■■■ 64
RPS3P23396 PSMB3-210ENST00000618159 562 ntTSL 28.41□□□□□ -1.061e-22■■■■■ 63.6
RPS3P23396 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.337e-18■■■■■ 63.4
RPS3P23396 AP000787.1-206ENST00000543150 1567 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.557e-18■■■■■ 63.4
RPS3P23396 AP000787.1-204ENST00000534891 777 ntTSL 27.45□□□□□ -1.227e-18■■■■■ 63.4
RPS3P23396 AP000787.1-207ENST00000540692 1201 ntTSL 26.38□□□□□ -1.397e-18■■■■■ 63.4
RPS3P23396 NDUFA4-204ENST00000482299 606 ntTSL 21.17□□□□□ -2.228e-10■■■■■ 63.3
RPS3P23396 LIPM-202ENST00000539337 1197 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.873e-9■■■■■ 63.3
RPS3P23396 LIPM-201ENST00000404743 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.943e-9■■■■■ 63.3
RPS3P23396 UQCRC1-210ENST00000493806 567 ntTSL 415.45■□□□□ 0.069e-10■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.184e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-201ENST00000264258 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-203ENST00000409028 1110 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.264e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-211ENST00000456292 357 ntTSL 24.72□□□□□ -1.654e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.734e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.734e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.734e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-210ENST00000441435 717 ntTSL 23.78□□□□□ -1.84e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-209ENST00000419276 781 ntTSL 53.27□□□□□ -1.894e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPS7-209ENST00000491937 987 ntTSL 225.16■■□□□ 1.622e-11■■■■■ 63.2
RPS3P23396 RPS7-205ENST00000462576 907 ntTSL 1 (best)25.16■■□□□ 1.622e-11■■■■■ 63.2
RPS3P23396 RPS7-207ENST00000479123 511 ntTSL 1 (best)15.69■□□□□ 0.12e-11■■■■■ 63.2
RPS3P23396 RPS7-208ENST00000481006 5429 ntTSL 1 (best)14.71□□□□□ -0.052e-11■■■■■ 63.2
RPS3P23396 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.32e-11■■■■■ 63.2
RPS3P23396 RPS7-203ENST00000406376 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.752e-11■■■■■ 63.2
RPS3P23396 RPS7-204ENST00000407445 833 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.082e-11■■■■■ 63.2
RPS3P23396 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.322e-11■■■■■ 63.2
RPS3P23396 PSMB5-206ENST00000555895 444 ntTSL 313.75□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 62.9
RPS3P23396 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 62.5
RPS3P23396 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 62.5
RPS3P23396 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-9■■■■■ 62.4
RPS3P23396 PSMB3-208ENST00000613870 662 ntTSL 38.27□□□□□ -1.092e-9■■■■■ 62.4
RPS3P23396 PSMB3-212ENST00000620309 552 ntTSL 26.97□□□□□ -1.292e-9■■■■■ 62.4
RPS3P23396 RPS17-203ENST00000559273 580 ntTSL 215.08■□□□□ 04e-15■■■■■ 62
RPS3P23396 AC245033.1-201ENST00000562833 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.954e-15■■■■■ 62
RPS3P23396 APOL1-209ENST00000433768 541 ntTSL 413.78□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 62
RPS3P23396 APOL1-204ENST00000422471 561 ntTSL 413.02□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 62
RPS3P23396 APOL1-208ENST00000431184 550 ntTSL 412.16□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 62
RPS3P23396 APOL1-210ENST00000438034 566 ntTSL 411.11□□□□□ -0.632e-9■■■■■ 62
RPS3P23396 APOL1-212ENST00000475519 600 ntTSL 49.47□□□□□ -0.892e-9■■■■■ 62
RPS3P23396 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.165e-8■■■■■ 61.6
RPS3P23396 MRPS21-202ENST00000614145 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.775e-8■■■■■ 61.6
RPS3P23396 HBG2-201ENST00000336906 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.841e-323■■■■■ 61.4
RPS3P23396 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.271e-323■■■■■ 61.4
RPS3P23396 NDUFB9-207ENST00000524241 654 ntTSL 26.98□□□□□ -1.293e-9■■■■■ 61.3
RPS3P23396 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.321e-14■■■■■ 61
RPS3P23396 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.131e-14■■■■■ 61
RPS3P23396 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.151e-14■■■■■ 61
RPS3P23396 ZFP64-212ENST00000477786 909 ntTSL 514.02□□□□□ -0.171e-14■■■■■ 61
RPS3P23396 ZFP64-202ENST00000346617 2876 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.611e-14■■■■■ 61
RPS3P23396 ZFP64-204ENST00000371515 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.721e-14■■■■■ 61
RPS3P23396 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.954e-17■■■■■ 60.8
RPS3P23396 RBM42-207ENST00000592526 1012 ntTSL 220.32■□□□□ 0.844e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.714e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 PLEKHG4-209ENST00000563969 6949 ntTSL 216.38■□□□□ 0.214e-9■■■■■ 60.8
Retrieved 100 of 24,271 protein–RNA pairs in 53.4 ms