Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TK1P04183 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TK1P04183 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TK1P04183 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TK1P04183 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TK1P04183 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TK1P04183 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TK1P04183 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TK1P04183 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TK1P04183 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TK1P04183 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TK1P04183 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TK1P04183 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TK1P04183 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TK1P04183 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TK1P04183 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TK1P04183 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TK1P04183 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TK1P04183 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TK1P04183 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TK1P04183 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TK1P04183 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TK1P04183 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TK1P04183 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TK1P04183 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TK1P04183 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TK1P04183 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TK1P04183 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TK1P04183 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TK1P04183 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TK1P04183 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms