Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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