Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PDGFRLQ15198 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDGFRLQ15198 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
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