Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms