Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KLF9Q13886 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KLF9Q13886 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KLF9Q13886 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KLF9Q13886 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KLF9Q13886 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KLF9Q13886 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KLF9Q13886 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KLF9Q13886 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KLF9Q13886 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KLF9Q13886 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KLF9Q13886 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KLF9Q13886 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KLF9Q13886 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KLF9Q13886 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KLF9Q13886 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KLF9Q13886 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KLF9Q13886 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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