Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFLP07196 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFLP07196 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFLP07196 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFLP07196 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFLP07196 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms